化学信息学(第二版)Ch8.pptVIP

DS Viewer ActiveX 的网页显示 DS Viewer ActiveX 的网页文件 OBJECT id=vwr style=LEFT: 0px; WIDTH: 436px; TOP: 0px; HEIGHT: 414px classid=clsid:90690CB6-BC07-11D4-AEF7-0050DA948176 width=436 height=414PARAM NAME=_Version VALUE=262144PARAM NAME=_ExtentX VALUE=5768PARAM NAME=_ExtentY VALUE=5477PARAM NAME=_StockProps VALUE=0PARAM NAME=Source VALUE=H:\Trypsin.pdbPARAM NAME=Mouse VALUE=1PARAM NAME=BackColor VALUE=0PARAM NAME=LightColor VALUEARAM NAME=DepthCue VALUE=0PARAM NAME=FastRender VALUE=1PARAM NAME=Projection VALUE=0PARAM NAME=GraphicsQuality VALUE=1PARAM NAME=SplitStereo VALUE=0PARAM NAME=StereoAngle VALUE=3.5PARAM NAME=ShowContextMenu VALUE=- 1PARAM NAME=SelectionMode VALUE=1PARAM NAME=Spin VALUE=0PARAM NAME=LineWidth VALUE=1.60000002384186PARAM NAME=Convert2Dto3D VALUE=1PARAM NAME=AutoAddHydrogens VALUE=0PARAM NAME=DisplayUnitCell VALUE=0PARAM NAME=UseAtomChargesFromFile VALUE=0PARAM NAME=UsePDBSecondaryStruct VALUE=0PARAM NAME=PerceiveAromaticity VALUE=0PARAM NAME=Animate VALUE=0PARAM NAME=AnimationPeriod VALUE=55PARAM NAME=HideModel VALUE=-1PARAM NAME=AtomDefaultStyle VALUE=71PARAM NAME=ProteinDefaultStyle VALUE=71PARAM NAME=DNADefaultStyle VALUE=71PARAM NAME=LockInput VALUE=0PARAM NAME=PrintDocument VALUE=121799712/OBJECT 第八章 化学结构的可视化 化学结构的表示 ? 命名法 ? 线型编码法 ? 二维结构 ? 三维结构 ? 表面结构 苯基丙氨酸的各种化学表示 ? 命名法：Systematic name：phenylalanine； Formula: C9H11NO2; C6H5CH2CH(NH2)CO2H ; IUPAC: 2-amino-3-phenylpropanoic acid ? 线型编码法:ROSDAL:1O-2=3O,2-4-5N,4-6-7=-12- 7； SMILES:NC(Cc1ccccc1)C(O)=O ? 二维结构 ? 三维结构 ? 表面结构 苯基丙氨酸的二、三维结构表示 苯基丙氨酸的表面化学结构表示 苯基丙氨酸溶剂可及表面网格图 苯基丙氨酸溶剂可及表面立体图 苯基丙氨酸的范德华表面立体图 苯基丙氨酸二维化学结构表示 苯基丙氨酸成键连接表 C1 C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 O10 O11 N12 C1 C2 C3 C4 C5 C6 C7 C8 C9 O10 O11 N12 0 1 0 0 0 2 0 0 0 0 0 0 1 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 1 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0