猕猴桃病毒A和B的RT-PCR检测及分子变异初步研究.pdfVIP

园艺学报，2015 ，42 (4) ：665 –671. Acta Horticulturae Sinica doi ：10.16420/j.issn.0513-353x.2014-0913；http ：//www. ahs. ac. cn 665 猕猴桃病毒 A 和 B 的RT-PCR 检测及分子变异 初步研究 1,2 1,2 1 1 1 1 1,2,* 郑亚洲 ，王国平 ，周菊芳 ，朱晨熹 ，王利平 ，徐文兴 ，洪 霓 1 2 （华中农业大学植物科技学院，湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室，武汉 430070 ； 农业微生物学国家重 点实验室，武汉 430070 ） 摘 要：为明确猕猴桃病毒 A （Actinidia virus A ，AcVA ）和猕猴桃病毒B （Actinidia virus B ，AcVB ） 在中国猕猴桃（Actinidia sp. ）上的侵染状况和分子特性，采用RT-PCR 技术对 151 份猕猴桃样品的 AcVA 和 AcVB 进行检测，检出率分别为 15.2%和 17.9%，所收集的 6 种猕猴桃样品中均检测到一种或两种病毒。 发现 AcVA 的 ORF1、ORF4 和 ORF5 扩增片段序列存在较大分子变异，不同分离物的 269 bp 片段（ORF1 ） 核苷酸序列相似性为 77.3% ~ 99.3% 。在基于各扩增片段核苷酸序列的系统进化树中，AcVA 分离物聚 为 2 ~ 3 组。采用引物 AcVB5F/5R 扩增获得 20 个 AcVB 分离物的 342 bp 或 338 bp 的 ORF5 片段，核苷 酸序列相似性为 81% ~ 100%，与新西兰AcVB 分离物 TP7-93B 相应片段的核苷酸序列相似性为 83.9% ~ 99.7%，在系统进化树中聚为 3 组。 关键词：猕猴桃；猕猴桃病毒 A ；猕猴桃病毒B ；RT-PCR ；序列分析 中图分类号：S 663.4；S432.4+ 1 文献标志码：A 文章编号：0513-353X （2015 ）04-0665-07 The Detection of Actinidia virus A and Actinidia virus B by RT-PCR and Their Molecular Variation Analysis 1,2 1,2 1 1 1 1 ZHENG Ya-zhou ，WANG Guo-ping ，ZHOU Ju-fang ，ZHU Chen-xi ，WANG Li-ping ，XU Wen-xing ， and HONG Ni1,2,* 1 （College of Plant Science and Technology，Key Lab of Crop Disease Monitoring and Safety Control in Hubei ，Huazhong 2 Agricultural University ，Wuhan 430070 ，China； National Key Lab of Agromicrobiology ，Wuhan 430070 ，China ） Abstract ：To understand the infectious status and molecular characteristics of Actinidia virus A （AcVA ）and Actini