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Matlab在分子动力学中的应用——Matlab实现的波包含时演化
Matlab在分子动力学中的应用——Matlab实现的波包含时演化
第33卷第2期
2011年6月
湘潭大学自然科学
NaturalScienceJournalofXiangtanUniversity
V0L33No.2
Jun.2011
Matlab在分子动力学中的应用
——
Matlab实现的波包含时演化
许继君,叶叶,闵存高
(泰州师范学院,江苏泰州225300)
【摘要】使用Matlab语言,通过数值求解含时薛定谔方程.计算了几种模型势(一维方势井,谐振子势,双井势)下的波
函数随时问演化过程.实践证明,使用Matlab语言处理波包的含时动力学问题,程序简洁而高效.所编制的程序具有酱适
性.只需稍作修改即可用于真实分子的含时动力学计算.
关键词:Matlab;波包;含时动力学
中图分类号:TP39文献标识码:A文章编号:1000—5900(2011)02—0108—04
ApplicationofMatlabinMolecularDynamics:
TheTime.DependentEvolutionofWavepacketviaMatlab
XUJi-jun.Ye.MINCun-gao
(TaizhouTeachersCollege.Taizhou225300China)
IAbstract】Thetime-dependentevolutionofwavepacketiscalculatedinseveralmodelpotential(suchasone
dimensionalbarrierpotential-hamonicoscillatorpotentialanddoublewellpotentia1)byusingMatlablanguage.It
isdemonstratedthatMatlabisapowerfullanguageforcalculatingthemoleculartime-dependentdynamics.Thepro?
gramisuniversa1.Useronlyneedalittlemodificationtocalculatetherealmoleculartime-dependentevolution.
Keywords:Matlab;wavepacket;time?dependentdynamics
化学反应,在波恩?奥本海默近似下,可以被描述为波包在势能面上的运动.波包在势能面上如何
随时间演化,能量在各振动模式问如何传递,波包在势能面的马鞍点如何选择通道以及各通道之间
的分支比,这些问题一直是分子动力学研究工作者关注的课题.因为对这些问题的解答,有可能敲开化
学家的终极梦想——分子剪裁的大门.尤其在飞秒激光成为化学家研究化学反应的工具后,人们真
的能够看到实时的波包运动,含时波包动力学的研究越来越炙手可热¨】.
含时波包动力学,归根到底,就是求解含时薛定谔方程:
..,,^^^2,2
ih:(,),:+:一+.
d£.Z,nZm
含时薛定谔方程的求解涉及的数学往往比较高深,算法较为繁杂,算法的程序实现,调试也比较复
杂,这些对化学工作者尤其是实验工作者构成了较大的障碍.本文采用草稿本式的计算语言Matlab,
选择一种较为流行的算法——分裂算符(splitoperator)方法,计算了波包的一维势垒穿透,波包在谐振
子势以及双井势中的运动.结果表明,Matlab把化学工作者从繁复的数学中解放出来,抓住物理思想核
心,程序编写高效,简单,是研究含时波包动力学的利器.
本工作对从事量子力学,量子化学与结构化学的教育工作者也有参考意义.初学量子力学的学生往
往难于接受物质波,几率幅这些基本概念,并且会伴随诸如波是如何部分反射部分穿透过去的
这一类问题.而由于种种原因,学生在教材中接触到的多是不含时薛定谔方程,定态等概念.如果教师能
够让学生看到波函数的真实的运动,必能大大有利于学生摆脱固有的经典概念而加深对量子力学的
理解的.
?收稿日期:2010一I1—18
基金项目:江苏省现代教育技术研究立项课题(21033)
通信作者:许继君(1972一),男,江苏泰州人.博士,副教授.E-mail:jijunxu@gmail.eom
第2期许继君,等Matl~在分子动力学中的应用
1分裂算符方法(SplitOperator)
含时薛定谔方程的形式解是(t):(1):e—.,其中()称为时间演化算符引,.为初
始波函数.若我们研究[0,t]时间范围内的波包演化,把时间轴用N个步长为At的格点表示,NAt=t.
则:u(t)=e-=f—-iHat/he-~A—
vhe-iHat/h
,其中At内的时间演化算符e-舳,^一e-ffAt/he,此处近似
,Y瑚
是假设[,]可以忽略.为了减
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