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PLATON常用功能1画图(ORTEP格式)
常用的有
Graphic里的ORTEP/ADP,点击此选项可以画出类似ORTEP要求的图片,但是比ORTEP-3用起来要方便的多
Incl-H atoms 可以让你选择是否显示H原子
Probability 让您选择椭球度(10%-90%)
ViewOptions 让您选择程序认为的重叠最少的几个视角,如果还是遮挡,则用RotX,RotY,RotZ来调节
LablSize调节标号的大小
Decoration 可以让土周围的那些字去掉(点一下您就知道了)
最后画完了,点击bw-EPS-col,点击时,偏左即选择黑白,偏右即彩色
这时在您的数据所在的原文件夹中产生一个 .ps各式的文件,用photoshop 等软件打开即可。
1. 元素的热振动因子情况统计:
搜索词:Averages per Element
示例:
Non-H C H Eu N O
Average 0.0502 0.0528 0.0677 0.0312 0.0410 0.0501
Minimum 0.0282 0.0282 0.0250 0.0312 0.0379 0.0321
Maximum 0.1410 0.1410 0.1692 0.0312 0.0485 0.0909
Ratio 5.0000 5.0000 6.7676 1.0000 1.2797 2.8318
Number 56 32 32 1 7 16
2. 计算3元-24元环平面
搜索词:Nr
示例:
Nr 1 P Q R S Sigref 0.003 Sigpln 0.006 Chisq 8.2 Pl.Hyp. P5
Ring 0.9488(6) -0.1535(17) -0.2760(17) 3.45(2) #O(3) 0.003(2) #N(2) -0.003(3) #N(3) 0.005(4) #C(16) -0.005(4)
说明:Nr 1代表第一个环
#O(3) 0.003(2) #N(2) -0.003(3) #N(3) 0.005(4) #C(16)代表这个环(或者平面)是由O(3) N(2) C(16)组成的
3.计算二面角:
搜索词:Angles (Degrees) Between Planes
示例:
1, 2= 75.1(3) 1, 3= 1.95(19) 1, 4= 3.6(2) 1, 5= 72.0(2) 1, 6= 8.62(14) 1, 7= 57.37(17) 1, 8= 61.32(19)
1, 9= 86.15(17) 1,10= 52.05(18) 1,11= 34.29(19) 1,12= 1.95(15) 1,13= 19.0(2) 1,14= 20.5(2) 1,15= 39.6(2)
1,16= 75.3(2) 1,17= 14.2(2) 1,18= 72.05(19) 2, 3= 74.0(3) 2, 4= 72.0(3) 2, 5= 4.8(3) 2, 6= 73.7(2)
2, 7= 69.6(2) 2, 8= 31.5(3) 2, 9= 19.4(2) 2,10= 58.4(3) 2,11= 80.4(3) 2,12= 73.5(2) 2,13= 83.6(3)
说明:1, 2= 75.1(3)代表由环1、环2平面的二面角为75.1(3)度
4.计算平面Q, T值(每个原子偏离由该组原子构成平面的程度)
搜索词:Ring Puckering Analysis
示例:
====================================================================================================================================
6-Membered Ring ( 1) Cu(1) -- O(3) -- C(21) -- C(16) -- C(15) -- N(
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