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大数据及其技术挑战(ACM-2014)精选
评论文章
DOI:10.1145/2611567 其 他 科 学 家 使 用。 不 仅 如 此, 随
探索在挖掘大数据潜力时面临的内在技术挑战 着技术日益进步,特别是在下一
代 测 序(NGS) 出 现 后, 可 用 的
作者:H.V. JAGADISH, JOHANNES GEHRKE , 试验数据集的规模和数量均呈指
ALEXANDROS LABRINIDIS , YANNIS PAPAKONSTANTINOU , 13
数级增长。
JIGNESH M. PATEL ,RAGHU RAMAKRISHNAN ,
按每台单独的 NGS 机器产生
CYRUS SHAHABI
的原始序列 数 据 计 算, 当 前 NGS
方法的输出增长速度如图 1 所示,
图中还描绘了 SPECint CPU 基准的
大数据及其技性能增长情况。很明显,对于单线
程应用(本文中的 SPECint)来说,
NGS 序列数据的增长远远超过了摩
术挑战 尔定律提供的性能增长。请注意,
图 1 中的序列数据大小为分析 NGS
仪器实际产生的原始图像后得出的
输出结果。由于这些原始图像数据
集本身规模太大(每天每个实验室
产生数个 TB 的数据),即便是在
现在,考虑保存他们也不切实际。
而且,序列数据是在实时分析图像
时产生并保存的。
大数据不仅对科学研究带来巨
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