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细菌基因组自动化流程1.1.1_测试文档
微生物细菌自动化流程测试报告
微生物研究部:产品研发组
2013 年05 月13 日
目录
1 引言3
1.1 编写目的3
1.2 背景3
1.3 定义3
1.4 参考资料3
2 工作流程4
2.1 总体流程图4
2.2 测试概要5
3 测试结果及发现5
4 对软件功能的结论8
4.1 能力8
4.2 限制8
5 分析摘要8
5.1 能力8
5.2 建议8
5.3 评价8
1 引言
1.1 编写目的
本测试报告为细菌自动化流程的测试报告,目的在于总结测试阶段的测试以及分析测试
结果,描述系统是否符合需求。
本《测试文档》的读者设定为以下人群:
1. 软件设计与开发人员;
2. 从事生物信息学和基因组学研究的软件用户。
1.2 背景
a . 本流程全程“细菌基因组自动化流程”。
b . 本项目由深圳华大基因科技服务有限公司微生物研究部产品研发组进行需求调查、
需求分析、流程设计、流程开发、流程调试和流程维护工作。
c . 本流程的用户是从事生物信息研究和细菌基因组组装和分析相关的科研单位。
d . 本流程是在华大内部日常操作中提出需求的。
e . 该流程将主要运行在深圳华大c 基因科技服务有限公司的大型计算机上。
1.3 定义
无。
1.4 参考资料
无。
2 工作流程
2.1 总体流程图
原始solexa
reads处理
下机数据
clean data 基因组组装
基因组组装
结果序列
组装达到标
否 结束
准?
是
基因预测、TRF、
ncRNA、Gis、前噬
菌体预测
基因功能注释
SNP、Indel、共线性、
Core-Pan、系统发育 ref
树、基因家族分析
结束
2.2 测试概要
用例
输入 预期结果
编号
1 运行主程序 得到细菌信息分析各部分的结果文件
2 运行数据过滤及组装模块 得到过滤后的数据及组装
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