稻田养殖沙塘鳢对稻田水体及底泥微生物群落结构及多样性的影响.pdfVIP

稻田养殖沙塘鳢对稻田水体及底泥微生物群落结构及多样性的影响.pdf

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淡水渔业,2017,47 (4): 8-14 2017年7月 Freshwater Fisheries            Jul.2017 稻田养殖沙塘鳢对稻田水体及底泥微 生物群落结构及多样性的影响 赵翔刚, 罗  衡, 刘其根, 赵良杰, 蔡林荣, 戴亮亮, 张  真 (上海海洋大学, 农业部水产种质资源与利用重点开放实验室, 上海201306) 摘要: 为了研究养殖沙塘鳢(Odontobutis obscurus)对稻田水体及底泥的微生物群落结构及多样性的影响, 2015 年 于浙江海盐江南四阡现代农业公司进行了沙塘鳢的稻田养殖实验, 利用DGGE(Denaturing Gradient Gel Electropho- resis)技术对养殖过程中的稻田水体及底泥中细菌的16S rDNA片段进行指纹图谱分析。 DGGE条带测序分析结果 显示: 稻田水体及底泥共检测到包括α-变形菌亚门(Alphaproteobacteria)、 β-变形菌亚门(Betaproteobacteria)、 γ-变 形菌亚门(Gammaproteobacteria)、 δ-变形菌亚门(Deltaproteobacteria)、 ε-变形菌亚门(Epsilonproteobacteria)、 绿菌门 (Chlorobi)、 酸杆菌门(Acidobacteria)、 厚壁菌门(Firmicutes)、 放线菌门(Actinobacteria)、 蓝藻门(Cyanobacteria) 等细菌门类。 多样性分析结果显示, 养殖沙塘鳢的稻田底泥微生物DGGE条带数多于常规养殖稻田, 养殖稻田 的底泥Shannon多样性指数2.86, 显著高于常规稻田的2.27, 同时养殖稻田养殖沟底泥的Shannon多样性指数随 养殖时间由2.56变化到2.16。 PCA(Principal Component Analysis)及DGGE聚类分析结果显示, 养殖稻田的水体 及底泥微生物群落结构与常规稻田存在较大差异。 结果表明, 稻田养殖环境的微生态条件可能优于常规稻田。 关键词: 稻田养鱼; DGGE; 沙塘鳢(Odontobutis obscurus) 中图分类号: S931.3          文献标识码: A          文章编号: 1000-6907-(2017)04-0008-07 Influence of the cultured Odontobutis obscurus to the microbial community structure and diversity in rice-fish system ZHAO Xiang-gang, LUO Heng, LIU Qi-gen, ZHAO Liang-jie, CAI Lin-rong, DAI Liang-liang, ZHANGZhen (Key Laboratory of Aquatic Genetic Resource and Utilization,Ministry of Agriculture/ Shanghai Ocean University,Shanghai201306, China) Abstract: In ordertostudyinfluenceoftheculturedOdontobutisobscurustothemicrobialcommunitystructureanddiversi- ty in rice-fish system.We investigated the microbial diversity of the water and sedime

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