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2010年-3病毒遗传分析
第3章 病毒遗传分析 感染后期,子代噬菌体的头部蛋白将这些多连体DNA分子包装起来,直到完全装满为止,每个噬菌体颗粒能包装多长的DNA分子取决于壳体本身,通常填滿头部所需的DNA超过从a到z的一套基因组,对在z后面的基因仍有空间可以包装,于是又继续包装基因a、b、c,至头部被装满时将DNA切断,由此可以看到这个病毒粒子是基因a、b、c冗余的,下一个病毒粒子将接从d起始的DNA分子开始包装至c,然后继续到d、e、f,这个病毒是d、e、f冗余的,再下一个病毒粒子从g开始包装,冗余g、h、i基因等等。 这种头部满装机制(headful mechanism)的特殊DNA包装方式就解释了噬菌体颗粒中基因的末端冗余和基因次序的环状排列:所有的子代病毒都携带有冗余DNA分子,及这种分子是不同基因冗余的。 一、 ?噬菌体基因组与原噬菌体 (一) ?噬菌体的基因组:由48500bp构成 基因分类 7个(必需基因:相邻)head 11个(必需基因:相邻)tail 噬菌斑形成必需的基因 复制所需基因:O、P 裂解、释放所需基因:S、R 基因 正调控基因:N、Q 附着区:att; 专一性重组所必需:int、xis 噬菌斑形成非必需基因 溶源化所需:CI、CII、CIII 重组所必需:exo、red (二)、 ?原噬菌体与合子诱导 1、?原噬菌体: 2、合子诱导: Hfr(λ)? F-→受体菌裂解(λ进入F-) Hfr(λ)[F因子整合、λ原噬菌体],F-[无F] (三)、原噬菌体的插入与切除 1、噬菌体的插入与原噬菌体正常切除 2、原噬菌体的异常切除 (1)转导噬菌体:带有细菌基因的噬菌体 (2)?d 转导噬菌体的特点——局限性转导 3、?dgal(?左臂缺失) 四、基因的转录与调控 前早期转录 PL和PR分别负责启动子向左和向右的转录; PRE和PRM是转录cI基因的两个启动子, PRE主管建立溶源, PRM主管维持溶源; PI启动转录int基因; P’R负责晚期基因的转录。 λ噬菌体赖以发展作为基因克隆载体: 非必要基因由外源基因取代所形成的重组噬菌体DNA,可以随着寄主大肠杆菌细胞一道复制和增殖,而且在其溶源周期中,它们的DNA是整合在大肠杆菌的染色体DNA上,成为后者的一个组成部分。 gag编码病毒粒子基质蛋白、衣壳蛋白、核酸结合蛋白 pol编码反转录酶、整合酶和蛋白酶 env编码病毒外膜蛋白 RNA基因组的中部带有gag,pol与env三个“基因”,“基因”这一术语在这里表示为编码区,每一编码区通过加工实际上产生出多种蛋白质。 R U5 PBS gag pol env U3 R m7GpppG AAAAA R :10-80bp正向重复序列 U5:50-100碱基 U3:170-1250碱基 PBS:tRNA引物结合位点 反转录病毒的生活周期 R U5 PBS U3 R PBS R U5 PBS U3 R PBS R U5 PBS U3 R PBS R U5 PBS R U5 PBS U3 5’ 3’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ 5’ PBS R U5 PBS
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