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R语言的由来 R语言是从S语言演变而来的。 S语言是二十世纪70年代诞生于贝尔实验室，由Rick Becker, John Chambers, Allan Wilks开发。 基于S语言开发的商业软件S-plus，可以方便的编写函数、建立模型，具有良好的扩展性，取得了巨大成功。 1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和Ross Ihaka，编写了一种能执行S语言的软件，并将该软件的源代码全部公开，这就是R软件，其命令统称为R语言。 R是开源软件，代码全部公开，对所有人免费。 R可在多种操作系统下运行，如Windows、MacOS、多种Linux和UNIX等。 R需要输入命令，可以编写函数和脚本进行批处理运算，语法简单灵活。 目前在R网站上约有3000个程序包，涵盖了基础统计学、社会学、经济学、金融学、生态学、地理学、医学统计学、生物信息学等诸多方面。 下载和安装R The Comprehensive R Archive Network 简称CRAN，提供下载安装程序和相应软件包。 R主页 / Windows版本下载地址之一： /mirrors/CRAN/bin/windows/base/R-2.9.2-win32.exe 下载完成后，双击R-2.9.2-win32.exe 开始安装。一直 点击下一步，各选项默认。 菜单栏 快捷按钮 控制台 命令行 R程序包 为什么要安装程序包？ 特定的分析功能，需要用相应的程序包实现。 程序包是什么？ R程序包是多个函数的集合，具有详细的说明和示例。 Window下的R程序包是已经编译好的zip包。 每个程序包包含R函数、数据、帮助文件、描述文件等。 常用R程序包 base- R 基础功能包 stats- R统计学包 nlme- 线性及非线性混合效应模型 Graphics- 绘图 lattice- 栅格图 seqinr- DNA序列分析 cluster- 聚类分析 ecodist- 生态学数据相异性分析 mefa- 生态学和生物地理学多元数据处理 mgcv- 广义加性模型相关 mvpart- 多变量分解 nlme- 线性及非线性混合效应模型 Tsa- 时间序列分析 R程序包安装 1 连网时，用函数install.packages()， 选择镜像后，程序将自动下载并安装程序包。 例如： 打开RGui,在控制台中输入 install.packages(“ape) 2 安装本地zip包 路径：Packagesinstall packages from local files 选择光盘或者本地磁盘上存储zip包的文件夹。 查看帮助文件 如何知道 tsa 程序包内部都有哪些函数？ 最常用的方法： 1 菜单 帮助Html帮助 2 查看pdf帮助文档（从程序包下载页面下载） 查看帮助文件 1 help(t.test) 2 ?t.test 3 help.search(t.test) 4 apropos(t.test) 5 RGuiHelpHtml help 6 查看R包pdf手册 为什么要学习编程? 界面操作直观易学，但也存在一些不足： 操作的过程难以保存，数据处理不够灵活，在进行步骤繁多的数据处理工作时十分费时费力；在建立模型或自己编写函数时也会遇到困难。而这些困难可以通过编程解决。 R绘图简介 R绘图功能 R具备卓越的绘图功能，通过参数设置对图形进行精确控制。绘制的图形能满足出版印刷的要求，可以输出JPEG、TIFF、EPS、emf、pdf、png等各种格式。 绘图是通过绘图函数结合相应的选项完成的。 绘图函数包括高水平绘图函数和低水平绘图函数。 推荐的教材 R 语言与统计分析 汤银才 高等教育出版社 2008 R 统计建模与R软件 薛毅 清华大学出版社 2007 时间序列分析及应用 （R语言）Jonathan 机械工业出版社2011 多元统计分析及R语言建模 王斌会 暨南大学出版社 2010 人大经济论坛 / 网上的数学建模资源 全国数学建模网站 美国大学生数学建模竞赛 /undergraduate/contests/ 数学中国_数学建模交流基地 / 重庆大学国家级精品