北大生物信息学-shi2.pptVIP

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  • 2018-03-06 发布于江西
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北大生物信息学-shi2

势函数 长程相互作用 静电相互作用是长程相互作用 电荷-电荷 ~ 1/r 电荷-偶极 ~ 1/r2 偶极-偶极 ~ 1/r3 基于电荷基团的截断半径 Rc 以2个水分子为例 总相互作用能 -0.27kcal/mol O---O 29 kcal/mol O---H -59.4 kcal/mol H---H 29.2 kcal/mol 截断半径 范德华相互作用 0.8A 静电 1.4A Ewald加和 Ewald 1921提出用于一个粒子与盒子中其它粒子以及周期性盒子中其它粒子的相互作用 立方体边长 i,j,k=0,1,2,3…. 在中心盒中有N个电荷,电荷-电荷相互作用 n=0 中心盒 ‘不包括

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