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新一代TALEN对比cas9的优势
上海斯丹赛生物技术有限公司
新一代TALEN操作比cas9更加简单容易
TALEN 比cas9更加精确
TALEN相比cas9总体而言,投入成本更
低,更便宜
①新一代TALEN操作比cas9更加简单容易
做cas9需要对载体酶切,胶回收,而
TALEN可以实现一步连接。
新一代TALEN连接
1.设计序列,
选择模块
2.加样,
进行连接
4-5h完成
Cas9系统质粒构建
sgRNA设计和oligo合成
引物退火形成带粘性
末端的双链片段
线性化表达载体的制备
(酶切、胶回收)
双链oligo片段连接入
表达载体
②TALEN 比cas9更加精确
很多的文章和报道都说明了cas9的脱靶
问题。
No evidence for TALEN off-
targeting
TALEN无明显脱靶效应
本文结合全基因组测序法,在6个细胞
系中分别对设计的TALEN靶序列在基
因组上可能的10万个脱靶位点处进行
了检测,均未发现任何脱靶效应;对
外显子区进行测序比对,未发现
TALEN存在脱靶效应。
Ding Q, Lee YK, Schaefer EA, et al. A TALEN genome-editing system for generating
human stem cell-based disease models [J]. Cell Stem Cell, 2013, 12(2):238-51.
TALEN对基因进行有效编辑时
未检测到任何的脱靶突变
在这项新研究中,研究人员通过采用
显微注射法将MECP2 靶向TALEN质粒
导入猴受精卵中,成功对MECP2 进行
了有效基因编辑,且未检测到任何的
脱靶突变。
Liu H, Chen Y, Ni Y, et al. TALEN-Mediated Gene Mutagenesis in Rhesus and
Cynomolgus Monkeys[J]. Cell stem cell, 2014.
Evidence for CRISPR/Cas9 off-targeting
CRISPR-CAS9脱靶严重
结合对部分脱靶位点进行检测,发现6
处被研究的RGNs 靶位点中有4 处存在
脱靶效应。
CRISPR –Cas9脱靶如此严重,导致其
不适用于临床应用和治疗。
CRISPR –Cas9在多种细胞中存在普遍
脱靶。
Yanfang Fu, et al. High-frequency off-target mutagenesis induced by CRISPR-
Cas nucleases in human cells [J]. Nat Biotechnol, 2013.
Cas9脱靶效应无法避免
除了打靶位点,即使在
基因组的其他位置有某
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