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汇报人：杨圣 组 员：李鑫 钟超 徐雷锋 研究背景 基本信息 构建进化树 RLK1蛋白结构预测 实验计划 一 研究背景 ∗ 植物类受体蛋白激酶(receptorlikeproteinkinase,RLKs)在植 物的信号转导途径中发挥着重要作用。因其在植物抗逆相 关方面的作用，希望通过对某些RLKs的透彻研究，最终利 用基因改造提高农作物产量和对生物和非生物胁迫的抗逆 性。 植物RLKs 四个主要结构域 ∗ 1.胞外结构域(extracellularligandbindingdomain,ECLB） ∗ 2.跨膜结构域(transmembranedomain,TM) ∗ 3.保守的胞内激酶结构域(proteinkinasecatalyticdomain,PKC) ∗ 4.N 端信号肽（N-terminalsignalpeptide,SP ） 植物类受体激酶的结构模型与工作原理 RLKs主要分为以下6类： ∗1 具有S- 结构域（S-domain）型RLK ∗2 富含亮氨酸重复序列（leucine-richrepeats,LRRs）型 ∗3 WAK(Wall-assoeiated kinase) 类RLK ∗4 PRS(pathogenesis related proteins) 类RLK ∗5 PERK和CRINKLY 类似的RLK ∗6 凝集素型（lectin-like）RLK 植物类受体激酶按胞外结构域的分类 ∗ 我们实验室利用粳稻C418 为背景，籼稻Bg300 为供 体，构建了一批耐冷导入系群体K354 ，并在这批导 入系中定位了耐冷相关QTL 。利用基因芯片对C418 和K354在冷胁迫条件下的全基因组表达谱进行了比 较分析，在第8染色体的耐冷QTL 区域内筛选到一个 K354特异的受冷胁迫诱导的类受体蛋白激酶（ receptor-like kinases ，RLK）基因Os-RLK1 （Cold induced RLK1 ）。 二 基本信息 NCBI 凝集素 激酶 Uniprot ∗全长：719AA ∗分子功能：丝/ 苏氨酸蛋白激酶 ∗ 受体 ∗ 转移酶 猜测：凝集素类受体蛋白 三 构建进化树 在Uniprot 中搜索出了拟南芥的凝集素 下载39个标注过的蛋白序列 使用MEGA 5.0构建系统进化树 三 RLK1蛋白结构预测 plantCARE 启动子区分析 结果 RLK1基因的调控区域存在MeJA激素顺式作用元件 TGACG-motif、CGTCA-motif ，响应低温胁迫的顺式作 用元件LTR ，转录因子MYB 家族结合位点MBS ，所以 该基因的转录可能受激素、冷胁迫、MYB的诱导,该基 因的最终表达蛋白可能参与了激素信号的转导，植物 对冷胁迫的响应的转导。 信号肽预测 ∗通常的信号肤序列具有以下特征 一般含有15 一30个氨基酸残基，在N端或接 近N端的位置有1 一7个亲水的极性氨基酸残基， 带正电荷，此外，还存在一个由7 一8个疏水的 氨基酸残基组成的疏水核心。 预测结果 ∗ 没有信号肽 ∗PERK家族成员没有N端信号肽结构，尽管缺 乏N端信号肽，试验证实PERKI蛋白也定位在 细胞膜上。 跨膜区预测 ∗跨膜结构域一般由20个左右的疏水氨基酸残 基组成，