多重估计偏差的调整及其GWAS应用ArthurBerg-PersonalPsuEdu.PDFVIP

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2018-04-05 发布于天津
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多重估计偏差的调整及其GWAS应用ArthurBerg-PersonalPsuEdu.PDF

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多重估计偏差的调整及其GWAS应用ArthurBerg-PersonalPsuEdu

. 多重估计偏差的调整及其GWAS应用 . . .. . Arthur Berg 宾夕法尼亚州立大学，生物统计部门 joint with Jason Liao (Penn State) and Tim McMurry (Depaul University) 3 2 1 0 5 10 15 20 Motivation Fundamental Model Rank Bias Classical Bayes Empirical Bayes Simulations GWAS Multiple Hypothesis Testing 多重假设检验 .. . Example (杨树抗病得基因效应) . .. Suppose disease resistance in poplar is aﬀected by 10 SNPs with an odds ratio (优势比) of 2, and these SNPs along with 10 additional non-associated SNPs were tested (so they have odds ratio of 1). The most signiﬁcant estimated odds ratio will be biased up. We run a simulation (模拟实验). . .. . disease resistant not disease resistant AA/Aa n11 n10 aa n01 n00 Arthur Berg 多重估计偏差的调整及其GWAS应用 2 / 20 Motivation Fundamental Model Rank Bias Classical Bayes Empirical Bayes Simulations GWAS 模拟实验 -- 杨树抗病得基因效应