光合数据分析与模型拟合.pdfVIP

光合作用数据分析与模型拟合 基因有限公司农业环境科学部，北京，2004-12 近些年来我们国家植物生理生态学研究方兴未艾，其中光合作用研究属于热点研究方向，其涉 及到全球变化、碳循环、遗传、植物生理等多个研究角度。目前我们国家从美国进口的 LI-6400 光 合仪（美国LI-COR 公司生产，基因公司在中国大陆和香港地区独家代理）已经超过200 多台，在 科学研究工作中起到了重要的作用。 目前的研究工作中，随着我们公司培训工作的不断细化，国内用户在仪器的软硬件使用方面已 经基本上达到熟练程度。但是在数据的进一步分析处理与数学统计方面，国内的研究人员应用的还 不是很多。目前许多研究人员还使用二次曲线来拟合光曲线或ACI 曲线。这种拟合方式尽管拟合方 程的效果很好，但是由于缺乏机理方面的论证而无法进一步准确解释数据，导致我们的文章难以在 国际上著名的杂志得到权威认可。20 世纪70-80 年代，国内外学者建立了许多光合作用的机理模型， 影响最深远的是基于光合作用的羧化和电子传递两个基本过程、描述光合作用与生物化学之间相互 关系的叶片的Farquhar 模型等。本文试图利用光曲线的数据为例，通过二次曲线和模型拟合两种方 法来讨论这两种方法的优缺点和相关参数的计算方法。 1.二次曲线拟合 采用某个样本光曲线数据，我们利用Excel 软件来制图并进行二次曲线拟合。得到结果如图1。 30 25 1 s- 20 2 - m 2 l 15 y = -1E-05x + 0.033x + 1.9049 o m 2 u R = 0.8628 率 10 速 合 光 5 0 0 500 1000 1500 2000 2500 3000 -5 光强umolm-2s-1 图1 光曲线数据二次拟合方程与图形 通过这个图形我们可以首先设光强为零，得出光暗呼吸速率为1.9049 （这是错误的，因为呼吸 1 -1 -2 速率应该是负值）。另外，我们可以大致得出饱和点在 1500umols m 左右。而利用光合速率为零来 测量光补偿点，显然也会得出错误的数值状况。同时这种统计手段存在无法解释的致命弱点。 2.直线拟合的情况 当然您也可以利用植物叶片在200umolm-2s-1 以下的光强时，光曲线符合直线方程来准确计算出 光补偿点、暗呼吸速率和表观量子效率等参数。我们重新利用同一数据进行拟合如图2 。 12 y = 0.0681x - 2.7856 10