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est技术及其在哺乳动物早期胚胎研究中的应用

中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2007,27(8):87~91 EST技术及其在哺乳动物早期胚胎研究中的应用 1,2 1 1,2 胡 婕  苗向阳  冯浩咏 (1中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 北京 100094 2东北农业大学动物科技学院 哈尔滨 150030) 摘要 EST(expressedsequencetags,EST)是一段长约150~500bp基因表达的外源序列片段,是 由大规模随机挑取的cDNA克隆测序得到的组织或细胞基因组的表达序列标签。一个EST代表 生物某一时期的某种组织或细胞的一个表达基因。主要综述了EST技术的原理方法,哺乳动物 早期胚胎研究的理论基础以及EST技术在早期胚胎研究方面的应用,并讨论了利用EST进行研 究分析的发展趋势。 关键词 表达序列标签(EST) 早期胚胎 基因 中图分类号 Q819   日新月异的现代生物技术推动了生命科学的迅猛 国国立卫生研究院(NationalInstitutesofHealth,NIH) 发展,人类、水稻、小鼠、拟南芥、家蚕等生物基因组的 的生物学家 VenterJC在人类基因组计划(Human 测序完成给揭示生命规律,了解生命起源,分析生物功 GenomeProject,HGP)实施过程中提出了这种发现表达 能提供了大量的数据基础。但是由于实验条件不足、 [1] 基因的新方法 。该技术是将mRNA在体外反转录成 实验材料限制、数据过于庞大等多方面因素的限制,使 cDNA后克隆到载体上,构建 cDNA文库,再从 cDNA 得研究人员无法按照传统的方法对基因进行逐个的克 文库中大规模随机挑选cDNA克隆,对其3′端或5′端进 隆、研究、确定相互关系。有鉴于此,EST技术的出现给 行一步法测序(Singlerunsequencing)获得 EST。EST 这些问题的解决带来了新的、有效的方法。早期胚胎 就是一段长约150~500bp的基因表达的外源序列片 是生命发展的最初阶段,是揭示生命奥秘的基础,是细 [2,3] 段 。因为基因的mRNA剪接位点不同,所以可以获 胞生长、分裂最为旺盛的阶段,同时也是细胞具有全能 得多个cDNA的克隆,即EST可能对应于一个cDNA的 性的阶段,因此对其进行深入研究对生物的发育、分 某一部分,也可能代表 mRNA的不同剪接方式。因此 化、疾病等方面的研究有着重大的意义。通过 EST技 利用EST技术进行克隆基因或者分析基因的表达图 术,我们可以充分利用现有的数据库进行分析,减少实 谱,使得新基因的克隆和定位速度得到了飞跃性的发 验研究量,加快研究进程。 展;使得发现新基因的进度进一步加快,对已知基因功 1 基于EST的电子克隆技术 能的研究也进一步得到了完善。   伴随着近些年来飞速发展的计算机硬件技术和不 1.1 EST的基本原理 断普及的计算机应用技术以及联系越来越紧密的国际   表达序列标签(expressedsequencetags,EST)是从 互联网技术,三大国际生物信息数据库———美国国家 生物体表达基因mRNA序列中导出的一段 cDNA序 信息中心(NationalCenterofBiotechnologyInformation, 列,包括了表达基因的编码区域的一部分。199

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