第一包参考数据库及样本管理设备项目名称数量参数人类遗传突变
第一包:参考数据库及样本管理设备
项目名称 数量 参数 1 一、数据类型:
文献已经报道的与人类遗传疾病相关的遗传突变数据,包括近3年数据
二、技术参数:
突变数据量190000条
基因数量7000
HGVS170000个
mRNA剪切突变17000个
三、资质要求:
1、投标人需从事高通量测序相关业务,需自主拥有二代测序平台并提供平台证明材料;
2、具有多组学平台和联合分析能力;
3、具有ISO9001质量管理体系认证证书;
4、具有优良项目工作环境,如风淋系统;
投标人的服务对象在影响因子期刊上以第一作者(或通讯作者)发表并提供支撑材料。 1 一、数据类型:
恶性肿瘤病人组织和体液样本的组学数据以及病人临床预后等表型信息。
二、技术参数:
宏转录组数据要求:
每个样品分别建库测序,采用宏转录组的建库方式;
样品每个产生不低于 10G 的clean data;
Q2090,Q30≥80%;
碱基类型分布均匀且无分离现象;
信息分析要求:原始数据统计,序列拼接组装,基因预测,物种分类学注释,功能注释等;
项目完成周期不超过60个工作日。
宏蛋白组数据要求:
鉴定的蛋白质数目需在500-1000之间,通常情况下,差异蛋白质数目占总蛋白质数目的5%-15%,谱图3W-20W,谱图利用率20%-50%;
信息分析要求:蛋白质表达差异分析、差
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