第十八章 分子标记辅助选择育种教学课件.ppt

2、遗传作图的原理 与经典连锁检测一致，即基于染色体的交换与重组。用重组率来表示基因间的遗传距离。 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 3、遗传图谱构建的主要环节 建立作图群体 群体中不同植株或品系的标记基因型的分析 借助计算机程序建立标记之间的连锁群 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 构建遗传图谱，首先要选择合适的亲本及分离群体，亲本之间的差异不宜过大，否则会降低所建图谱的准确度和适用性。而亲本间适度的差异范围因不同物种而异。 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 4、用于分子标记的遗传作图群体 1）暂时性分离群体：包括F2群体、BC1等。这类群体中分离单位是个体，一经自交或近交其遗传组成就会发生变化，无法永久使用，由于每个单株所提供的DNA有限，且只能使用一代，限制了该群体的作图能力； 2）永久性分离群体：包括重组自交系群体（RIL）（由F2经多代自交一粒传后使后代基因组相对纯合的群体）、加倍单倍体群体（DHL）等。这类群体中分离单位为株系，不同株系之间存在基因型的差异，而株系内个体之间的基因型是相同且纯合的，自交后不会发生分离，因此可通过自交或近交繁殖后代，而不会改变群体的遗传组成，可以永久使用。 中 中 大 大 必要的群体规模 高 高 低 低 准确度 1:1 1:1 1:1 1:2:3或3:1 分离比例 品系 品系 个体 个体 性状研究对象 F2个体自交后代 F1花粉分化个体 F1回交后代 F1自交后代 群体 形成 RIL DH BC1 F2 不同作图群体的特点 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 （一）质量性状的分子标记 二、分子标记与基因定位 寻找与质量性状紧密连锁的DNA标记主要有两个目的： 在育种中对质量性状进行标记辅助选择， 对质量性状基因进行图位克隆。 主要途径 ： 近等基因系分析法（Near Isogenic Lines Analysis， NIL） 群体分离分析法（Bulked Segregation Analysis，BSA） 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 1、NIL（近等基因系）分析法 NIL分析法的原理： 如果一对近等基因系在目标性状上表现差异，那么凡是能在这对近等基因系之间揭示多态性的分子标记就可能位于目标基因的附近。 因此利用NIL材料，可以寻找与目标基因紧密连锁的分子标记。 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 基本步骤： 1）筛选与目标基因连锁的分子标记：利用分子标记技术分析一对近等基因系，筛选在两者间表现出多态性的引物或探针。 2）进行标记与目的基因连锁的验证：利用多态性标记/探针对近等基因系间杂交分离群体中的单株进行筛选，确定每个单株的标记基因型。同步对分离群体中单株的目标性状进行调查。 3）基因定位：利用Mapmaker等软件确定目标性状与标记之间的连锁关系，并计算遗传距离和绘制连锁图。 1、NIL分析法 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 2、BSA（群体分离）分析法 BSA法是从近等基因系分析法演化而来的，它克服了许多作物没有或难以创建相应的NIL的限制，对于尚无连锁图或连锁图饱和程度较底的植物，利用BSA法也是快速获得与目标基因连锁的分子标记的有效方法。 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 2、BSA分析法 BSA分析法的原理 在作图群体中，依据目标性状表型的相对差异（如抗病与感病、可育与不育等），将个体或株系分成两组，分别将两组中的个体或株系的DNA等量混合，形成相对的DNA池（DNA pool）。这两个DNA池之间除了在目标基因座所在染色体区域的DNA组成上存在差异外，来自基因组其它部分的DNA组成应该是完全相同或基本相同的，即两DNA池间差异相当于两近等基因系基因组之间的差异，或者说构成了一对近等基因DNA池。因此在这两个DNA池之间表现出多态性的DNA标记，就有可能与目标基因连锁。 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 基本步骤 1）根据目标性状表型或基因型的相对差异构建两个近等DNA池或代表群，寻找在两者之间表现多态性的标记。 2）利用分离群体验证候选标记是否与目标基因紧密连锁。 3）根据标记基因型的分离比例和单株目标性状分离比例进行遗传作图。 第二节 重要农艺性状基因连锁标记的筛选技术 （二）数量性状的分子标记 数量性状的遗传是受多基因控制的，遗传基础复杂，易受环境因素影响，表现为连续变异，表现型与基因型之间没有明确的对应关系。因此长期以来对数量性状的遗传研究只能借助于数理统计的手段，将控制数量性状的多基因系统作为一个整体