专题讨论拥有高植物生物量分解能力的草食昆虫微生物群系-农艺系.PDF

國 立 台 灣 大 學 農 藝 系 四 年 級 專 題 討 論 擁有高植物生物量 分解能力的草食昆蟲微生物群系 An Insect Herbivore Microbiome with High Plant Biomass-Degrading Capacity 作 者： Garret Suen, Jarrod J. Scott, Frank O. Aylward, Sandra M. Adams, Susannah G. Tringe, Adria´n A. Pinto-Toma´ , Clifton E. Foster, Markus Pauly, Paul J. Weimer, Kerrie W. Barry,Lynne A. Goodwin, Pascal Bouffard, Lewyn Li, Jolene Osterberger, Timothy T. Harkins,Steven C. Slater, Timothy J. Donohue, Cameron R. Currie 出處 ：PLoS Genetics 2010, September 主講學生： 林威廷 指導教授：蔡政安副 教授 時 間： 2011 年 12 月 1日上午 10 ：20 地點：農藝系館 112R -1- 摘要 草食性動物可 透過木質纖維素微生物的共生關係獲得分解細胞壁裡抗分解有機碳 的能力 。切葉蟻 （Attini ）就是一個典型的例子 ，這種螞蟻用新鮮的葉子在其建構的 園區培養真菌當作食物。透過糖成分分析，微生物基因組測序 ，和全基因組測序，我們 發現切葉蟻的真菌園區裡的微生物組成 了一個具有高植物生物質量降解能力的 多元細 菌社群 。這個微生物群測出的碳水化合物降解酶分析表與總體基因比較顯示出和牛的瘤 胃有很高的相似性，這說明了兩個重要的草食性動物在植物生物量分解的潛力在演化上 朝向同一個地方 。利用微生物基因組測序 ，真菌園區裡的兩種微生物提供了它們能夠分 解纖維素能力的證據。鑑於大家最近對纖維素生物燃料的興趣，作者試著 了解一個高度 進化的草食性昆蟲如何大規模 且快速的分解植物生物量 ，特別是關於 生物能源。 引言 植物細胞壁中含有地球上最大儲存量的有機碳。這種碳是在大多數生物中都無法發 現的 ，它以纖維素，半纖維素和木質素的形式存在其中 。 某些細菌和真菌能夠解構這些 抗分解的植物聚合物，而在生物圈的營養循環中扮演一個 關鍵角色 。木質纖維素微生物以植物生物量為飼料和動物形成共生關係，木質纖維素微 生物提供宿主獲得營養的管道，並且從宿主方持續不斷地獲得植物聚合物。 。最近的微生物研究發現這些動物裡的小型社群 如何調解植物生物量的解構 ，包括碎屑，反芻動物，和雜食動物。現在 ，作者要介紹 一個重要的新熱帶草食動物與 其微生物， 一種名為 Atta colombica的切葉蟻 。Atta屬的切葉蟻在新熱帶世界是一種 著名的、普遍的昆蟲 ，並形成數以百萬計的工人組成的殖民地，成熟的殖民地每年會收 集數百公斤的葉子，大大地改變 了森林的 生態系統並促進養分循環。切葉蟻不直接食用 它們收集來的葉子，而是用這些葉子的碎片當作根基來培養一個專門屬於 mutualistic 真菌的地下花園 （圖1B和 1C）。這些真菌作為殖民地初期的主要食物來源，提供一個 基地保護 家園不被競爭者侵犯。，並透過建立殖民地來散佈。儘管這些熱帶生態系統的 螞蟻和 Atta屬裡扮演關鍵位子的葉片起引起巨大的影響 ，我們目前對於這個真菌園區 的植物生物量分解了解仍然十分有限 。 結果和討論 切葉蟻的真菌園主要的功能便是將植物生物量轉換成營養給自身，就像一個外部的 消化系統，這個地下園區的頂層和底層有很大的不同，頂層放置著收集來的綠色葉片， 而底層則放置著成熟的真菌和部分分解的植物材料。這是為了切葉蟻轉換生物量的過程 需要，新鮮收穫的葉子集合在頂層，而底層的材料被螞蟻移走後會被堆放在一個垃圾堆 存處。園區裡分解生物量的工作看起來僅僅只靠切葉蟻的共生真菌 (傘菌目)