浅谈NIPT的临床应用.pptx

浅谈NIPT的临床应用湖南省妇幼保健院医学遗传科（073184332213） 贾政军产前筛查发展历程NIPT技术背景： 基于母血浆胎儿游离DNA的发现母体外周血含有的cffDNA，几乎全部来源于胎盘滋养层细胞；怀孕4周可检出，8周后含量上升并稳定存在；母体外周血中的cffDNA含量在5%-30%之间；孕周越大cffDNA含量越高，且与母亲体重有关半衰期短16.3min，产后2h后检测不到胎儿游离DNA：cell-free fetal DNA（cffDNA）Lancet.1997NIPT的技术基础 – 二代测序技术检测胎儿非整倍体导致母血浆游离DNA剂量变化20% 胚胎DNA含量T21胎儿正常胎儿二代测序胎儿DNA能发现什么疾病测序深度染色体非整倍体 唐氏综合征、爱德华氏综合征等染色体微缺失微重复综合征 Digeorge综合征、猫叫综合征等单基因病 耳聋、地中海贫血、苯丙酮尿症等…AAGCTTGCGACTTCAGTTAGCGCTAAGCCAGTGCATG…分析总结—检出率检出率NT筛查75% 早孕期整合筛查85%中孕期血清学筛查65%早中孕期联合筛查90%问题1：NIPT检测有多精准？分析总结—假阳性率21/18/13三体复合假阳性率0.43%（传统超声及血清学筛查假阳性率5%左右）NIPT临床应用优势NIPT血清学筛查无创取样 - 抽血孕周、预产期年龄信息质控有难度 -- 依赖孕妇年龄孕周等因素，临床+实验室的质控体系较难建立蛋白指标间接反应胎儿染色体病风险无创取样 - 抽血孕周范围广 --12周到26周质控容易 -- 不依赖孕妇年龄孕周等因素，容易建立标准实验质控体系DNA测序直接反应染色体拷贝数变化检出率、假阳性率、阳性预测值等技术指标远超传统筛查手段产前诊断有创性取样存在适宜孕周局限质控有一定难度 ：临床+实验室的经验问题2：NIPT适合什么样的人群？各年龄的非整倍体风险 ≥35岁高龄人群是NIPT最显著的受益者 临界风险及低风险人群也不容忽视风险因素T21%T18%T13%X/Y 非整倍体%其他染色体非整倍体%年龄（≥35岁）1.09%0.30%0.06%0.40%0.01%年龄（＜35岁）血清学高风险0.90%0.05%0.02%0.45%0.00%年龄（＜35岁）血清学临界风险0.48%0.07%0.03%0.49%0.00%年龄（＜35岁）T18 高风险0.11%2.71%0.00%0.45%0.00%年龄（＜35岁）血清学低风险0.33%0.46%0.07%0.52%0.00%YA: Young Age; HR: High Risk数据来自某国内检测平台2012.1.1到2013.12.19的151186例检测高危（高龄和筛查高危）人群的NIPT检出效率较高T21T18T13低危高危低危高危低危高危检出率95.9%97%86.5%93%77.5%95%假阳性率0.1%0.3%0.2%0.3%0.1%0.1%阳性预测值82%91%37%84%49%87%阴性预测值1:55701:10541:71941:9301:85061:4265但年龄高危或血清学筛查高危的孕妇按照法律规定应该建议产前诊断，而不是产前筛查Taylor-Phillips S, et al. BMJ Open 2016;6: 哪些人适合接受NIPT？血清学筛查、影像学检查显示为常见染色体非整倍体临界风险1/1000 ≤ 唐氏综合征风险值 1/2701/1000 ≤ 18三体综合征风险值 1/350有介入性产前诊断禁忌证者先兆流产发热有出血倾向感染未愈Rh阴性血型就诊时，患者为孕20+6周以上，错过血清学筛查最佳时间，或错过常规产前诊断时机，但要求降低21三体综合征、18三体综合征、13三体综合征风险的孕妇NIPT的临床数据显示： T21临界风险孕妇中，T21阳性率约0.48%，远高于T21在新生儿中的阳性率(1/600-1/800) 将临界风险人群纳入NIPT适用人群，对孕妇具有很好的收益，对出生缺陷的防控也具有积极的意义。北京协和医院开展的NIPT早孕期临床研究：12孕周前，约5%的孕妇胎儿游离DNA (cffDNA)含量低于NIPT检测的最低限4%，因此小于12孕周，NIPT检测存在假阴性风险。NIPT适用时间为12+0-26+6，较血清学筛查和羊膜腔穿刺的孕周范围更广。我院临床操作情况平 台贝瑞和康 NextSeq CN 500 120Gb数据量、 400M序列数、 双端测序操作简便、稳定通量高、质量好、应用广方 法贝瑞和康专利方法简便：无需PCR操作快速：前处理仅需4小时即可测序；分析软件处理一个样本平均仅需5秒一体化解决方案效 率快速满足临床需求快速处理、完成96个样本检测及报告节约人力成本操作流程提 取 1 HOURS