蛋白质组学医学院研究生课程2014概论课件.ppt

蛋白质组学概论;组学;蛋白质组是澳大利亚学者Williams和Wilkins于1994年首先提出，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的杂合,意指proteins expressed by a genome，即“一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质”。 ;二、蛋白质组学产生的背景- 从基因组学到蛋白质组学;;基因组学;海绵基因组草图 结果显示其中包含约１.８万个基因。海绵６亿多年前就出现在地球上，是已知最古老的多细胞动物，研究人员也在其基因组中找到了一些帮助单细胞动物进化为多细胞动物的关键基因，如指导细胞互相粘在一起的基因，以及使多个细胞能协调一致生长的基因。 虽然海绵结构简单，没有神经和肌肉等组织，研究人员还是在其基因组中发现了与高等动物体内指导神经与肌肉活动基因相似的基因。研究人员认为，海绵基因组的复杂程度说明进化成海绵的上一级动物比以前认为的更复杂，这将改变人们对多细胞动物起源的传统看法。 ;血吸虫基因组 ;基因组计划;基因组计划;基因组计划;;人类基因组计划;人类与黑猩猩的基因对比研究;人类基因组与尼安德特人的比较;;藏人与汉人的基因组比较;双倍体测序 （diploid?genome?sequence）;双倍体（diploid）测序;HAPMAP计划(国际人类基因组单体型图计划 );;全基因组关联研究;*;*;*;*;*;*;对两组共计5074名帕金森氏症患者和8551名健康人的DNA样本进行了调查，两组研究均证实，SNCA基因和MAPT基因发生突变与帕金森氏症有关。 将上述结果与针对日本帕金森氏症患者开展的另一个基因组相关性研究进行了比较。结果显示，在对日本患者开展的研究中，SNCA基因突变同样是帕金森氏症的一个主要风险。不同的是，后一项研究并未发现MAPT基因与日本人患帕金森氏症的相关性，这说明帕金森氏症这种复杂疾病的诱因可能存在人种差异。 ;全基因组关联分析 费力不讨好？;国际千人基因组计划 ;药物基因组学与个体化用药;药物在部分人中无效和疗效差;受试者人数;药物代谢遗传因素的决定性;年龄 老年人 儿童 新生儿;药物基因组学的概念; 个体对药物的反应在分子水平存在差异（“个体差异”） 药物基因组学是基因功能学与分子药理学的有机结合。 ???物基因组学是以药物效应及安全性为标，研究各种基因变异与药效及安全性的关系。 ;药物相关基因; 1）药物代谢相关的酶 2）药物结合相关的受体 3）药物转运相关的膜通道 4）信号传导相关的蛋白质等的编码基因;10q24.2;药物基因组的研究方法;候选基因分析;全基因组关联分析（GWAS）;GWAS分析SNP谱分层对药物治疗的反应人群;药物基因组学与个体化治疗;药物作用受药物代谢、转运、靶点多态性控制;药物基因组学与个体化医疗;EGFR信号通路和恶性肿瘤靶向药物治疗;增殖;K-ras发生率及药物疗效 ;个体化用药能够提高结肠癌的药物疗效;个体化用药降低结肠直肠癌治疗费用 - 美国;个体化用药降低结肠直肠癌治疗费用 – 我国;Han et al. J Clin Oncology 23(11),2006;;售价：550元/片。每天口服药物费用550元，每月费用16500元。 基因检测EGFR无突变患者可节省1-6个月的药费：16500元至99000元。 ;尘螨基因组测序; ; ;粉尘螨（Dermatophagoides farinae）;本项目的意义：;研究内容;新一代测序技术加快基因组研究;基因组研究的意义;功能基因组学;功能基因组的主要研究方法;基因表达谱与表型变化;基因表达差异;基因表达系列分析法（SAGE）;蛋白质表达差异;通过动物模型研究人类基因功能;基因敲除;;;;基因敲除;酵母的基因敲除;Distribution of functional classes of essential (inner circle) and nonessential (outer circle) ORFs.;小鼠的基因敲除;;;蛋白质相互作用研究基因的功能;酵母双杂交技术;定点突变研究基因的功能;定点突变;新型基因敲除技术;基因组学的局限;基因组学的局限;基因组学的局限;基因重排;抗体类别转换;前体的剪切;可变剪切;不同的剪切;;RNA编辑;基因组学的局限;;Intein（可以剪切的蛋白质） ;;Cyclic peptide;基因组学的局限;基因组学的局限;基因组学的局限;基因组学的局限;基因组学的局限;基因组学的局限;基因组学的局限;12.在寻找靶标时力不从心。 蛋白质是各种代谢及调控途径的最主要的执