第5讲 近交系数与 及亲缘系数 群体与 及数量遗传学 .pptVIP

问题 近亲结婚增加了后代患隐性遗传疾病的风险。计算堂兄妹婚姻中, 群体发病率为16/10000的遗传性疾病发生的风险增加了多少? R=1／8 t世代群体的近交系数Ft 每一世代群体规模保持不变 t世代群体的近交系数Ft 如果连续世代中规模不等,怎么办？ 应对每一世代的规模进行调和平均。 三、群体近交系数的估计 当群体中雌雄个体数不相等时，怎么办？ 应进行调和平均。 Nf=母畜数量；Nm=公畜数量 Ne:群体有效规模 在实际群体中，当 Nf Nm 举 例 一畜群,基础群近交系数为0,连续9个世代保持闭琐繁育,而且公畜数始终保持2头。 估计当前这个群体的近交系数。 作业3 一个闭锁群体，每代随机留10母3公，经过5代，估计平均近交系数，经过50代又达多少？ 一个闭锁群体，每代随机留10母3公，经过5代，估计平均近交系数，经过50代又达多少？ 三、群体近交系数的估计 3、连续规则近交下的群体近交系数 (1)连续全同胞交配 (2)连续半同胞交配 (3)连续与同一个体回交 回顾：近交系数与亲缘系数的关系 三、群体近交系数的估计 3、连续规则近交下的群体近交系数 (1)连续全同胞交配 N代 N-1代 N-2代 r(n-1) r(n-2) P1 P2 三、群体近交系数的估计 N代 N-1代 N-2代 r(n-1) r(n-2) P1 P2 3、连续规则近交下的群体近交系数 (1)连续全同胞交配 三、群体近交系数的估计 3、连续规则近交下的群体近交系数 (2)连续半同胞交配 N代 N-1代 N-2代 r(n-1) r(n-2) P1 P2 三、群体近交系数的估计 3、连续规则近交下的群体近交系数 (3)连续与同一个体回交 A是N-1世代及N世代个体的父亲 N代 N-2代 N-1代 rA(n-2) P1 a2 a1 P2 A A与n-1世代个体的亲缘系数 N代 N-2代 N-1代 rA(n-2) P1 a2 a1 P2 A N代 N-2代 N-1代 rA(n-2) P1 a2 a1 P2 A 小结连续规则近交下的群体近交系数 (1)连续全同胞交配 (2)连续半同胞交配 (3)连续与同一个体A回交 连续规则近交下各世代近交系数 世代 全同胞交配 半同胞交配 连续回交(FA=0) 0 0 0 0 1 0.25 0.125 0.25 2 0.375 0.21875 0.375 3 0.5 0.304688 0.4375 4 0.59375 0.380859 0.46875 5 0.671875 0.44873 0.484375 6 0.734375 0.509155 0.492188 7 0.785156 0.562958 0.496094 8 0.826172 0.610863 0.498047 9 0.859375 0.653517 0.499023 10 0.88623 0.691495 0.499512 四、近交的遗传效应 世代 AA Aa aa 0 P0 H0 Q0 1 P0+(1/4) H0 (1/2) H0 Q0+(1/4) H0 2 P0+(1/4) H0 +(1/8) H0 (1/4) H0 Q0+(1/4) H0+(1/8) H0 3 P0+(1/4) H0 +(1/8) H0 +(1/16) H0 (1/8) H0 Q0+(1/4) H0+(1/8) H0 +(1/16) H0 N P0+(1/2)[1-(1/2)n] H0 (1/2)n H0 Q0+(1/2)[1-(1/2)n] H0 举例 世 代 AA Aa aa 0 0 1 0 1 0.2500 0.5000 0.2500 2 0.3750 0.250 0.3750 3 0.4375 0.1250 0.4375 4 0.4688 0.0625 0.4688 p q 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 四、近交的遗传效应 杂合率（H）： Hn＝ H0（1-Fn） Hn :n世代的杂合子频率 H0 :起始代的杂合子频率 Fn ：n世代的群体近交系数 四、近交的遗传效应 1、有限群体中每一世代杂合率的变化 四、近交的遗传效应 1、有限群体中每一世代杂合率的变化 不同规模、起始杂合率时各世代杂合率的变化 四、近交的遗传效应 2、连续规则近交下的群体杂合率变化 (1)连续全同胞交配 N代 N-1代 N-2代 r(n-1) r(n-2) P1 P2 四、近交的遗传效应 2、连续规则近交下的群体杂合率变化 (2)连续半同胞交配 N代 N-1代 N-2代 r(n-1) r(n-2) P1 P2 四、近交的遗传效应 2、连续规则近交下的群体杂合率 (3)连续与同一个体回交 N代 N-2代 N-1代 rA(