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PCR检测HBVPPT
PCR法检测HBV
实验原理
PCR技术的基本原理
类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:
①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;
②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;
③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链。
重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~4分钟, 2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。
琼脂糖凝胶电泳原理
琼脂糖凝胶电泳是重组DNA研究中常用的技术,可用于分离、鉴定和纯化DNA片段。不同大小、不同形状和不同构象的DNA分子在相同的电泳条件下(如凝胶浓度、电流、电压、缓冲液等),有不同的迁移率,所以可通过电泳使其分离。凝胶中的DNA可与荧光染料溴化乙锭(EB)结合,在紫外灯下可看到荧光条带,借此可分析实验结果。
实验材料
1. 模板:重组质粒(将乙肝病毒特定段基因导入到质粒中)
2. 特异性引物
上游引物:5’-CACCTCCTCCTGCCTCCACCAATC- 3’(1299-1322)24 bp
下游引物:5’-GGCCCCCAATACCACATCATCCAT- 3’(2133-2157)24bp
3. DdH2O,缓冲液10×buffer+Mg2+,dNTP,Taq
4. 溴酚兰 :BIOER,Lot NOstorage -20℃
5. Marker:BIOER,BioDL2000,Lot NO实验仪器
1. 电泳仪,生产厂家:北京百晶生物技术有限公司,型号BG-Power600
2. 基因扩增仪,生产厂家:EPPENDOF
3. UVP Bioimaging systems,American UVP corporation,GDS-8000 system
4. 微型漩涡混合器,上海康华仪器制造有限公 司,型号WH861
5. 微量加样器,生产厂家:北京百晶生物技术有限公司
6. EP管
②从管中分别吸取23μl混合液加入到另外5 个EP管中,然后分别向其中4个管中加入阴性对照、阳性对照、实验组1、实验组2四种模板2μl,另一管中加入2μlH2O做空白对照。
③将以上五管放入离心机中离心,封口,放入基因扩增仪中扩增,反应条件如下:
94℃预变性5min
94℃变性45s
62℃复性45s
72℃延伸45s
72℃延伸10min
第二、三、四项设置为20个循环
琼脂糖凝胶电泳
①将琼脂溶化后浇到电泳板上,待其凝固。
②琼脂凝固后将胶板放入电泳槽中,注意有加样孔的一端放在阴极,然后向电泳槽中倒入缓冲液直至没过琼脂胶板。
③从各管中分别取出6μl混合液与1μl溴化乙锭混合均匀,加入到点样孔内,注意不能把胶插破,也不能让液体溢出到孔外。
④盖上电泳槽盖,接通电源,开始电泳。
UVP成像
电泳完毕后,将胶板放到UVP凝胶成像系统中成像,观察并对照结果 。
实验结果及讨论
实验结果
从左到右各区带依次为阴性对照、阳性对照、实验组1、实验组2、空白对照和Marker。
(1)除Marker外,其余各带均比较模糊。
(2)非特异性区带比较明显。
(3)假阴性,不出现扩增条带。
(4)假阳性 。
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