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亚棉A中EF-1α的克隆与分析 指导老师:黄晋玲教授 班 级:植检091班 学 号:2009010721 答 辩 人:马 华 江 目 录 背 景 目的意义 设计思路 试验结果 结果分析 讨 论 背景 EF-1α(Elongation Factor 1-alpha)作为棉花的翻译延伸因子,在棉花的发育过程中起重要作用。 EF-1α广泛存在于盐地碱蓬、豌豆、水稻、奥利亚罗非鱼等多种动植物体内,它除了在蛋白质合成中具有重要作用还有可能与细胞分裂、植株发育及衰老等动植物生理活动有关系。 目的及意义 对亚棉A中EF-1α的研究,有助于进一步揭示亚棉A中的EF-1α功能,推动棉花育种工作。 试验思路 本研究以亚棉A为试验材料,采用CTAB法提取DNA,以陆地棉中EF-1α为模板,利用Primerpremier5.0软件设计引物,经PCR同源克隆对亚棉A中EF-1α片段进行扩增,将所得基因送交检测机构测序,最后利用BLAST软件获得比对结果。 试验结果 用CTAB法提取出的DNA质量检测图: BLAST比对结果 与棉花WGS库比对结果: BLAST比对结果 与nucletide数据库比对结果: 结果分析 本试验扩增得到亚棉A中EF-1的部分序列,共580bp,BLAST比对结果表明该基因与G. hirsutum(陆地棉)中EF-1α的相似度达到了95%。由于EF-1α在物种间具有高度保守性,因此同源克隆得到的亚棉A基因片段为EF-1α片段。 * * * 琼脂糖凝胶电泳图: 测定结果 谢谢大家 * *
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