实时荧光定量PCR技术原理应用及实践RealtimeQuantitativePCR.PPTVIP

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  • 2018-08-01 发布于天津
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实时荧光定量PCR技术原理应用及实践RealtimeQuantitativePCR.PPT

实验流程法实验流程样本处理提取数据分析逆转录样本处理与提取外界刺激可检测的表达改变样品离开定义环境裂解固定细胞酚异硫氰酸胍裂解液氰酸胍异硫氰酸胍液氮保存液小心污染使用阴性对照逆转录逆转录引物选择下游应用是否检测其它基因的干扰检测灵敏度是否足够一步法还是两步法两步法反转录和扩增分两步进行步骤多但灵活多样可长期保留检测多个基因便于反应优化在工作的初期一步法反转录和扩增在同一管内完成简便快捷但只做一个基因一旦失败难以查找原因在工作的成熟阶段荧光定量体系聚合酶总原则与普通相同避免引物二聚体避免二级结构扩

* * * * * * * * * 实 验 流 程 SYBR Green法实验流程 样本处理 RNA提取 qPCR 数据分析 逆转录 样本处理与RNA提取 外界刺激 –10min – 可检测的表达改变 样品离开定义环境 –2min– 裂解、固定细胞 TRIzon(酚、异硫氰酸胍) 裂解液 (氰酸胍,异硫氰酸胍, SDS) 液氮 RNA保存液 小心DNA污染! 使用DNase 阴性对照 逆转录 逆转录引物选择 下游应用:是否检测其它基因? Abundant RNA的干扰:mRNA or total RNA? 检测灵敏度是否足够? RT-PCR一步法还是两步法? 两步法: 反转录和PCR扩增分两步进行。 步骤多但灵活多样。cDNA可长期保留检测 多个基因。便于反应优化。在工作的初期。 一步法:反转录和PCR扩增在同一管内完成。 简便、快捷但只做一个基因,一旦失败 难以查找原因。在工作的成熟阶段。 荧光定量PCR体系 Template Primers DNA聚合酶 Buffer and dNTPs Dye 总原则与普通PCR相同: 避免引物二聚体,避免二级结构 扩增片段长度(80 - 300bp) 推荐做跨intron设计 引物设计原则 Master

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