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第八节基因工程跟体外表达
中南大学生物科学与技术学院
分子生物学研究中心
教 案
授课科目: 医学分子生物学授课内容: 基因工程与体外表达授课对象:医学七年制 、八年制
授课时数: 6学时授课教师: 曾海涛授课地点: 授课时间: 授课教材:医学分子生物学(21世纪高等院校教材)
胡维新主编,北京:科学出版社,2007,
第一版
第八章 基因工程与体外表达
一、目的要求:
掌握:常用克隆载体;基因克隆的基本过程;外源基因在大肠杆菌和哺乳动物细胞中表达的原理和方法。
熟悉:限制性核酸内切酶和其他常用工具酶的概念和特点;定点诱变技术原理。
了解:昆虫表达系统;酵母表达系统。
二、讲授重点:
基因克隆的基本过程。
三、讲授难点:
α-互补筛选;阳性转染细胞的筛选;定点诱变技术原理。
四、教学方法:多媒体教学
五、教 具:多媒体课件
六、讲授内容:
第一节 基因工程中的工具酶
?一、限制性核酸内切酶(restriction enzyme)
限制性核酸内切酶是基因克隆中最重要的工具酶,主要从原核细胞中提取。它是一种核酸内切酶,能从双链DNA内部特异位点识别并且裂解磷酸二酯键。
1.限制性核酸内切酶的分类
Ⅰ型酶具有限制和DNA修饰作用。这种酶在非特异性位点,通常在识别位点下游100到1 000bp处切割DNA。
Ⅱ型酶 能在DNA分子内部的特异位点,识别和切割双链DNA,其切割位点的序列可知、固定。
Ⅲ型酶与Ⅰ型酶一样,具有限制与修饰活性,能在识别位点附近切割DNA,切割位点很难预测。
2.限制性内切酶的命名
EcoRⅠ E代表Escherichia属
co代表coli 种
R代表RY13株
3.限制性内切酶的识别和切割位点
通常是4~6个碱基对、具有回文序列(palindrom)的DNA片段,大多数酶是错位切割双链DNA,产生5ˊ或3ˊ粘性末端(sticky end)。
如EcoRⅠ切割后产生5ˊ粘性末端.
PstⅠ切割后产生3ˊ粘性末端.
有一些酶沿对称轴切断DNA,产生平端或钝端(Blunt end), 如SmaⅠ.
二、其他常用的工具酶
1. DNA聚合酶Ⅰ (DNA polymerase I)
有聚合酶活性, 3ˊ→5ˊ核酸外切酶活性, 5ˊ→3ˊ核酸外切酶活性。
2. DNA聚合酶Ⅰ大片段
DNA聚合酶Ⅰ大片段(large fragment of DNA polymerase I)为DNA聚合酶I用枯草杆菌蛋白酶(subtilisin)裂解后产生的大片段,这个片段也称为Klenow片段(Klenow fragment)。
有5ˊ→3ˊ聚合酶活性, 3ˊ→5ˊ核酸外切酶活性, 无5ˊ→3ˊ核酸外切酶活性
Klenow片段的主要用途有:
(1) 补齐双链DNA的3ˊ末端。
(2) 通过补齐3ˊ端,使3ˊ末端标记。
(3) 在cDNA克隆中,第二股链的合成。
(4) DNA序列分析。
3. 逆转录酶(reverse transcriptase)
是一种RNA依赖的DNA聚合酶,即以RNA为模板合成DNA,合成时需要四种脱氧核苷酸及3ˊ-OH引物,合成方向为5ˊ→3ˊ延伸,无3ˊ→5ˊ外切酶活性。广泛用于以mRNA为模板合成cDNA,构建cDNA文库。
4. T4 DNA连接酶(T4 DNA ligase)
T4 DNA连接酶催化双链DNA一端3ˊ-OH与另一双链DNA的5ˊ端磷酸根形成3ˊ→5ˊ磷酸二酯键,使具有相同粘性末端或平端的DNA两端连接起来。
5. 碱性磷酸酶(alkaline phosphatase)
能去除DNA或RNA 5ˊ端的磷酸根。制备载体时,用碱性磷酸酶处理后,可防止载体自身连接,提高重组效率。
6. 末端脱氧核苷酸转移酶
末端脱氧核苷酸转移酶(terminal deoxynucleotidyl transferase, TdT),简称末端转移酶。它的作用是将脱氧核苷酸加到DNA的3ˊ-OH上,主要用于探针标记;或者在载体和待克隆的片段上形成同聚物尾,以便于进行连接。
第二节 基因克隆的载体
外源DNA一般没有明显的遗传标志,如果将其直接导入宿主细胞,没有有效的方法将导入了外源DNA片段的细胞和没有导入外源DNA的细胞区分开来。此外,外源DNA导入宿主细胞后,不能随宿主细胞的繁殖而复制,即没有自主复制能力,达不到使外源DNA片段扩增的目的。如果要将外源DNA片段导入宿主细胞进行扩增或表达,就需要有一个能在该宿主细胞内进行自我复制和表达的载体(vector)来携带。外源D
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