脊椎动物线粒体DNA进化遗传学.PDFVIP

动物学杂志 Chinese Jout．a]ofgoology 脊椎动物线粒体 DNA 的进化遗传学 桂 建 劳 (ga国科学院水生生物研究所) 近年来 ，在分子进化遗传学 研 究 中又产 基因之间；这个区域含有一突出结构——D环， 生 出一个新的生 长 点，这 就是 线粒 体 DNA 它 由与 L链互补 的一小段 DNA 合成 ，并在这 (mtDNA)的进化遗传学研究。 因为 mtDNA 一 区域取代了H链。D环既可作为H链合成的 结构简单 ，与拥有 4×10到 4× 10“个碱基 起始子 ，又可作为一种方式把取代的H链序列 对 的多细胞动物 的核基 因组相比，比其最小者 显露 出来 ，使它能被一些特异分子所识别 (如 小 25000倍 ；在不 同物种间，mtDNA 上 的基 被 RNA 聚合酶识别 ，就可作为转录的起始序 因成分相对稳定 ，很少受到序列重排 的影 响；另 列) 。 一 方面 ，mtDNA 又具有广泛的种 内和种间多 mtDNA 的复制和转录都不对称。 其编码 态性 ，且为母性遗传，在亲缘关系相近的物种间 的基 因信息不对称地分布在两链之 中，在 37个 其进化速度比核基 因快 ，因而它为从分子水平 转录基 因中，仅 9个 基 因 (8个 tRNA、1个 上研究种群遗传学和进化遗传学提供 了理想 的 mRNA 基因)由L链编码 ，其余的都由H链编 研究对象”_’。 码 一 、 脊椎动物 mtDNA的 二、mtDNA 的限制性内切酶分析 结构和基因成分 mtDNA 的限制性 内切酶分析首先是从细 脊椎动物 mtDNA 是一条环状的双股分 胞 中分离 出纯 mtDNA，然后分别用识别序列 子o Anderson 和 Bibb等先后对人 、牛和小 不同的限制性 内切酶消化处理，切割成大小不 鼠的 mtDNA 进行了完整 的序列分析 。 人 的 同的片段 ，再通过凝嵌电泳将这些片段按分子 mtDNA 由 16569个碱基对组成，牛的由16338 量大小分离开来，并通过染色或放射 自显影技 个碱基对组成 ，小 鼠的由 16295个碱基对组成。 术显示 ，供分析之用 。 在线粒体基 因组中，台有 2个 rRNA 基 因 (12 因为 mtDNA 是一密 闭的环状分子 ，所 srRNA和 16srRNA)，22个 tRNA基 因Jl3 以通过一种内切酶消化产生的片 段 数等 同于 个 mRNA 基 因。已知有 5个 mRNA 翻译的 mtDNA 中这种酶 的识别位 点数。 一般来说， 产物是线粒体电子传递系统中的亚单位，其余 “识别 6个碱基 的酶随 mtDNA 的来原不同 mRNA 也可锯翻译了，但其蛋 白质产物还未鉴 可产生 l一8个片段 ，而 “别 4个磁基”的酶可 定 出来 。 产生多到 2o个或更多的片段。因为片段愈多， 线粒体基因组中没有居间序列；基因间的 愈难通过凝胶电泳分开和讽别 ，故一般采用识 间隔序列要么没有，即使存在也仅由 1到几个 别 5或 6个碱基 的内切酶 。 核苷酸组成 ；基 因、转录物和产物 呈现 完全 的共 mtDNA 限制性 内切酶分析的最后一步 也 线性关系。少数碱基对构成 了复制起始区的特 是最关键 的一步就是统计和分析。一般根据有 有序列 ，位于编码脯氨酸和苯丙氨酸 tRNA 的 机体 (包括物种 、种群、个体等)间共有消化片段 的比例来决定其 mtDNA 的遗传相似性。 许 f mH u‘lus) 和家鼠 (MusdoDtt：ticuO 多学者 已建立了几种统计步骤来将这些祝放的 之间揭示出 mtDNA 的种间流动现象之后 ，已 “片段 或 “位 点 数据转化成 m*DNA 间核苷 在家 鼠和三音 鼠 (MusmolosHus)、响板 鼠 酸顺