中国棘缘蝽属的DNA条形码研究.pdfVIP

目录 第三节数据处理和分析方法……………………………………………23 2．3．1数据整理………………………………………………………………………23 2．3．2序列特征分析…………………………………………………………………23 2．3．3遗传距离分析…………………………………………………………………23 2．3．4系统发育树分析………………………………………………………………23 2．3．5 ABGD分析…………………………………………………………………………………………一24 2．3．6 jMOTU分析……………………………………………………………………………24 2．3．7指标向量(Indicatorvector’)分析…………………………………………25 2．3．8鉴定成功率分析………………………………………………………………25 2．3。9几种方法的比较及应用………………………………………………………25 第三章实验结果…………………………………………………………27 第一节序列特征分析结果………………………………………………27 第二节遗传距离分析结果………………………………………………28 第三节系统发育树分析结果……………………………………………一35 第四节ABGD分析结果…………………………………………………．．37 第五节iMOTU分析结果……………………………………………………38 第六节指标向量(Indicatorvector”)分析结果………………………．．4l 第七节鉴定成功率分析结果………………………………………………42 第四章总结与讨论………………………………………………………43 第一节棘缘蝽属条形码研究结论………………………………………．43 4．1．1禾棘缘蝽应当为稻棘缘蝽的异名……………………………………………43 4．1．2稻棘缘蝽种内存在较大的遗传分化…………………………………………44 4．1．3中国存在短肩棘缘蝽…………………………………………………………45 4．1．4长肩棘缘蝽种内存在前胸背板侧角长度的变异……………………………45 第二节DNA条形码可以应用于棘缘蝽属物种的鉴定……………………46 第三节综合取样与DNA条形码鉴定准确率的关系……………………46 参考文献……………………………………………………………………48 致谢……………………………………………………………………………………………．56 个人简历……………………………………………………………………57 VT 万方数据 第一章引言 第一章 引言 第一节I)NA条形码 1．1．1 DNA条形码简介 1．1．1．1 DNA条形码的提出 条形码已经被广泛用来标记商品，它的原理是利用11个数字的排列组合 (1011种组合)来代表有限的商品种类，同理如果我们把数字换成核苷酸，也可 以用不同核苷酸的排列组合来代表不同的物种。理想状态下每一个物种都有唯 一的序列，从而可以达到根据DNA序列来区分物种的目的。DNA条形码是用 线粒体基因组C015’端的一段短的、标准的648bp片段来区分不同物种的方法。 快速准确鉴定物种的可行性。经分析发现，种内平均遗传距离为0．25％，而种间 平均遗传距离为6．8％，绝大多数种类种间遗传距离都大于3％。同年Hebert等 3320个物种的C01 又分析了GenBank上包括脊椎动物和无脊椎动物共11门1 序列，发现除刺胞动物外，98％