应用扩展版RAS研究试剂盒检测FFPE样本中的低频体细胞突变.PDFVIP

应用说明 SeqStudio和3500 / 3500xL基因分析仪 应用扩展版RAS研究试剂盒检测FFPE样本中的 低频体细胞突变 优化Sanger测序性能 本报告涵盖的内容如下： 扩展版RAS试剂盒检测亮点 使用针对8个最常研究的KRAS和NRAS热点区域的扩展版 • 检测限(LOD)为5 RAS研究试剂盒 • 扩大了RAS覆盖范围(8个常研究KRAS和NRAS基因热点 • 在Applied Biosystems™SeqStudio™基因分析仪-我们 区域) 产品系列中最新的毛细管电泳仪-上使用扩展版RAS试 • 快速出结果(例如，3500xL基因分析仪6小时/ 6个样本) ， 剂盒进行金标准Sanger测序 且手动操作时间短 • 使用扩展版RAS试剂盒检测低频变异，并在SeqStudio和 •提供准确和完整的双向序列信息 Applied Biosystems 3500xL两种毛细管电泳仪平台上进 •即用型平板 行性能对比。 •DNA起始量要求低(低至1 ng /反应) Sanger测序常用于肿瘤研究中癌症的基因分析。A pplied Biosystems™ Minor Variant Finder (MV F)软件现支持在 兼容仪器： Sanger测序中进行低频变异检测。这在检测体细胞突变方 • SeqStudio基因分析仪 面尤为重要。 • Applied Biosystems™3500和3500xL基因分析仪 由于某些癌症(如结肠直肠癌) 的RAS突变谱与其抗表皮生 “新的SeqSt ud io基因分析仪快速、直 长因子受体(EG FR)反应之间的高度相关性，临床研究人 员经常进行RA S突变检测。在携带RA S突变的肿瘤中激 观、使用简单。与q PC R平台相比，在 活的MA PK途径更可能赋予其对抗表皮生长因子抑制剂的 SeqStudio系统上使用RAS试剂盒进行的 耐受性[1] 。 全面分析可获得详细的序列信息，所需低 以下是使用基于即用型Sanger测序的扩展版RAS试剂盒检 质量FFPE DNA起始量更低。” 测的亮点，用于高灵敏鉴定福尔马林固定石蜡包埋(FFPE) 样本中的低频突变(低至5%) 。 —Luca Quagliata 博士，高级主管 (瑞士) 巴塞尔医科大学 使用MVF软件进行sanger测序的优势： 准确和完整的双向序列信息：Sanger测序能够鉴定所有 检测限为5% ：与MVF软件结合使用时，Sanger测序可将检 需要的热点变异，以及序列上下游整个扩增子长度上的许 测下限降至5% ，即临床研究人员常推荐的临界标准。 多其他变异。大多数基于qPCR的方法仅可检测热点突变 “ 是”或 “否”存在-不能准确识别特定变异或提供序列 扩展版的RAS覆盖范围：我们已经开发出针对8个KRAS和 信息。特定的等位基因和附加的序列信息不仅在检测新突 NRAS基因的热点区域(外显子2的12-13 区域，外显子3的 变方面重要，更可能对特定变异产生功能