条斑紫菜藻红藻蓝蛋白α和β亚基基因序列测定及分析.PDF

ISSN 1007 -7626 中国生物化学与分子生物学报 http :/ / cjbmb . bjmu . edu . cn 20 11 1 年 月 CN 11-3870 / Q Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology 27 (1):62 ～ 68 、 条斑紫菜藻红 藻蓝蛋白α 和 β 亚基基因序列测定及分析 * ， ， ， ， ， 蔡春尔 贾 睿 李春霞 陆秀芬 张 璐 何培民 ( ， 20 1306 ) 上海海洋大学水产与生命学院 上海 (Pea ) (Peb ) 、 (Pca ) 摘要 为了获得江苏吕泗的条斑紫菜藻红蛋白 α 和 β 亚基 藻蓝蛋白 α 和 β (Pcb) DNA ， 、 . 亚基基因的 序列 本文对其基因进行了克隆 序列测定及分析 根据已发表的基因序列 (DQ666487. 1) ， DNA PCR ， 设计引物 对提取自条斑紫菜叶状体的 进行 和电泳鉴定 产物经测序证 实获得藻红蛋白序列1 357 bp (HM008263. 1)和藻蓝蛋白序列1 335 bp (HM008262. 1). 上述两段 序列与已报道的条斑紫菜相关序列(DQ666487. 1)同源性均为99 % ，与其它几种紫菜相关序列同 88% ～ 98% . ， 5 ′Untranslated Regions (UTR)- 源性为 两段序列均采用多顺反子转录策略 排布顺序为 Peb -间隔区- Pea -3 ′UTR 和 5 ′UTR- Pcb -间隔区- Pca -3 ′UTR . 文中对基因翻译所得氨基酸序列做 、 . 、 、Shine-Dalgarno (SD) 了理化参数 功能位点及空间构型的预测 基于对序列开放阅读框 启动子 序