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单增李斯特菌溶源性噬菌体的分离鉴定及部分基因功能研究-预防兽医学专业论文
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上海交通大学
学位论文原创性声明
本人郑重声明:所呈交的学位论文《单增李斯特菌溶源性噬菌体 的分离鉴定及部分基因功能研究)) ,是本人在导师的指导下,独立进 行研究工作所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外,本论文不 包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的作品成果。对本文的研 究做出重要贡献的个人和集体,均己在文中以明确方式标明。本人完 全意识到本声明的法律结果由本人承担。
学位论文作者签名 : 军芳哼
日期: 乞创叶年 1月 (0 日
上海交通大学
学位论文版权使用授权书
本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定, 同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的 复印件和电子版, 允许论文被查阅和借阅。本人授权上海交通大学可以将本学位论文的 全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可以采用影印、缩印或扫 描等复制手段保存和汇编本学位论文。
保密口,在一-年解密后适用本授权书。
本学位论文属于 /
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学位论文作者签名 :是慧 指导教师签名 : 2 伍尖
日期:w l 千 年 !月(0 日 日期: t01今年 f 月 (0日
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一_- -
上海交通大学硕士学位论文
上海交通大学硕士学位论文
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单增李斯特菌溶源性噬菌体的分离鉴定及部分基因功能研究
摘 要
单增李斯特菌(Listeria monocytogenes, LM)是一种重要的人兽共 患病原菌,噬菌体是一类专一寄生的细菌病毒,具裂解循环或溶源循环。 PCR 及其扩增产物的序列测定显示 38 株单增李斯特菌分离株中的 16 株在 tRNAArg 位点携有原噬菌体,利用丝裂霉素 C 诱导获得一株溶源 性噬菌体,透射电子显微镜观察表明该噬菌体为长尾噬菌体,命名为 W001,DNaseI、RNaseA 和绿豆核酸酶消化噬菌体基因组的结果确认 其核酸为 dsDNA。鸟枪法测定 W001 基因组序列,run-off 法确认其基 因组末端具有 COS 位点 5’-CGGTGTGGGG-3’, W001 基因组全长为 42,227 个碱基,由 66 个开放阅读框组成,噬菌体整合核心序列 attPP’-AATCCCTCTCAGGACG 位于噬菌体整合酶下游。
第 20 个开放阅读框编码全长为 281 个氨基酸的噬菌体裂解酶 PLYW001,该酶由 NH2 端的催化结构域(Enzymatically Active Domain, EAD 和 COOH 端的结合结构域(Cell-wall Binding Domain,CBD)组 成,利用大肠杆菌表达并制备裂解酶,Ni 柱纯化,Bradford 法定量裂解 酶蛋白浓度,浊度递减法测定 PLYW001 的裂解活性和裂解谱, PLYW001 可裂解包括噬菌体 W001 宿主菌 HA1073、EGDe、10403s 在内的 1/2a 血清型的单增李斯特菌;氨基酸替换突变研究结果显示位 于裂解酶 PLYW001 催化结构域的 7 个氨基酸(45R、50Q、64S、66H、 73D、115D 和 118H)与裂解酶活性相关。
PCR 分别扩增 EGFP 和裂解酶 CBD 编 码 基 因 , 构 建 载 体 pET28a-EGFP-CBD,大肠杆菌表达融合蛋白 EGFP-CBD,Ni 株纯化 制备 EGFP-CBD,激光共聚焦显微镜观察证明 CBD 可结合于单增李斯 特菌细胞壁。
在整合酶作用下,噬菌体基因组 DNA 以 attPP’位点特异性整合
I
至宿主细菌基因组 DNA 的 attBB’位点。利用噬菌体 W001 的整合酶
构建非李斯特菌复制型质粒 pHAL2,并电转化 actA/plcB 缺失的单增 李斯特菌 LM-1003 感受态细胞,PCR 扩增产物的序列测定表明该质粒 成功整合至 LM-1003 基因组特异性 tRNAArg 位点,因此,质粒 pHAL2 可用于基因敲除菌株的基因互补。
关键词:单增李斯特菌;噬菌体;裂解酶;整合酶
II
ISOLATION, CHARACTERIZATION AND FUNCTIONAL STUDY OF PARTIAL GENES OF LYSOGENIC PHAGE W001
OF LISTERIA MONOCYTOGENES
ABSTRACT
Listeria monocytogenes is an important zoonotic pathogen. phage is a virus that can specifically infect bacteria, and may have a lytic cycle or a lysogenic cycle. The results of
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