黄瓜嫩果皮色基因QTL定位分析.PDFVIP

植物遗传资源学报2018,19(6):1138鄄1142 Journal of Plant Genetic Resources DOI:10.13430/ ki.jpgr.20180122001 黄黄瓜嫩果皮色基因QTL定位分析 窦文文,沈摇 镝,麦尔旦 ·努尔阿伍提,董洪霞,邱摇 杨,李锡香 (中国农业科学院蔬菜花卉研究所/ 农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京100081) 摇 摇 摘要:以黄瓜(Cucumissativus L.)嫩果皮绿色自交系1613(P1)和嫩果皮白色自交系JD7(P2)为试验材料构建重组自交系 (RIL)群体(142 个株系),对各株系嫩果皮色进行表型鉴定,利用重测序技术对各自交系进行基因分型,结合表型和基因型数 据进行QTL定位研究。 结果表明F 黄瓜嫩果皮颜色表现为绿色,并将控制嫩果皮颜色的基因定位到黄瓜第3号染色体上,在 1 3号染色39711114 区段内定位到成簇分布的3 个位点,它们在连锁图谱上的位置分别为1郾01 cM、3郾31 cM和 6郾01cM处,与两翼标记的连锁距离分别为1郾01cM/ 0郾09cM,0郾21cM/ 0郾29cM,0郾11cM/ 0郾19cM。 通过生物信息学分析预测出 16个候选基因,其中Csa3G904080、Csa3G904100、Csa3G903500和Csa3G902950极有可能是调控黄瓜果实颜色的关键基因。 关键词:黄瓜;RIL;嫩果皮色;重测序;QTL定位 QTL Mapping of Immature Fruit Basal Color in Cucumis sativus L. DOU Wen鄄wen,SHEN Di,NUERAWUTI Maierdan,DONG Hong鄄xia,QIU Yang,LI Xi鄄xiang (Vegetable and FlowerResearch Institute of ChineseAcademy of Agricultural Sciences/ Key Laboratory of Horticultural Crop Biology and Germplasm Creation,Ministry of Agriculture,Beijing 100081) Abstract:By taking use of 142 recombinant inbred lines (RILs) derived from a cross of green immaturefruit inbred line (female parent,1613,P1) and white immature fruit inbred line (male parent,JD7,P2),we performed the quantitativemappingoftraitsthatcontroltheimmaturefruitskincolor. F plantsshowedgreenpeelinimmature 1 fruit. By sequencingtechnology,three QTLscontrollingtheimmaturefruitcolorwereallocatedtothephysicalinter鄄 val o39711114 on chromosome3. Theselociwerelocatedat 1郾01cM,3郾31cMand6郾01cM,withthe flanking genetic distance of 1郾01cM/ 0郾09 cM,0郾21 cM/ 0郾29 cM and0郾11 cM/ 0郾19 cM,respectively. By gene annotation,16 candidate genes were found in the target region,including the genes Csa3G904080,Csa3G904100, Csa3G903500 and Csa3G902950,w