基于基因组DNA混合池EST-SSR引物快速筛选方法研究.PDFVIP

第32 卷 第9 期 中 南 林 业 科 技 大 学 学 报 Vol. 32 No. 9 2012 年9 月 Journal of Central South University of Forestry Technology Sep. 2012 基于基因组DNA混合池的EST-SSR引物快速筛 选方法研究 1 1 2 2 刘 果 ，谢耀坚 ，张党权 ，谷振军 （1. 国家林业局桉树研究开发中心，广东湛江 524022；2. 中南林业科技大学；a. 林业生物技术湖南省重点实验室；b. 经 济林育种与栽培国家林业局重点实验室；c. 经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室，湖南长沙410004 ） 摘 要：林木SSR 标记的引物筛选工作量大，十分费时且消耗大量实验材料。采用基因组DNA 混合池技术， 将研究对象的若干个基因组DNA 样品等量混合后，作为单一模板进行SSR 的PCR 扩增，能显著降低实验的工 作量和成本。以选择的150 对EST-SSR 引物为对象，对6 个桉树基因组DNA 样品进行等量混合，进行PCR 扩 增筛选引物，结果表明，与常规筛选方法相比，基因组DNA 混合池方法大幅度缩短了实验周期，显著减少了基 因组DNA 的消耗，可用于大量林木SSR 引物的快速高效筛选。 关键字：基因组DNA 混合池；引物筛选；EST-SSR ，PCR 中图分类号：S792.39 文献标志码：A 文章编号：1673-923X(2012)09-0124-06 Studies on quick screening of EST-SSR primers based on genomic DNA mixing pool 1 1 2 2 LIU Guo , XIE Yao-jian , ZHANG Dang-quan , GU Zheng-jun (1.China Eucalypt Research Centre, Zhanjiang 524022, Guangdong, China; 2.a. Hunan Provincial Key laboratory of Forestry biotechnology; 2b. Key Laboratory of Non-wood Forest Products of State Forestry Ministry; 2 c. Key Laboratory of Non-wood Forest trees and protection of Ministry of Education, Central South University of Forestry and Technology, Changsha 410004, Hunan, China) Abstract: The screening of SSR primers for forestry is a heavy research which is very time consuming and consume intensive experimental materials. By employing genomic DNA pooling technology, a method of mixing several genomic DNA templates equivalently as the single