四基因工程操作过程.pptxVIP

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  • 2019-01-07 发布于上海
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四基因工程操作过程

Genetic Engineering1.基因工程概述2.基因工程的基础知识与基本技术3.基因工程所需基本条件4.基因工程的操作过程5.目的基因的获取6.克隆基因的表达7.转基因生物技术4 基因工程的操作过程A重组体的构建(切、接)B重组体导入受体细胞(转、增)C重组体的筛选和鉴定(检)切接转增目的蛋白检载体DNA外源DNA连接 重组分子电穿孔或显微注射转化或转导 真核细胞原核细胞(受体细胞) 扩增或表达 表达A重组体的构建 粘性末端的连接 平末端的连接 PCR产物的连接 DNA体外连接应注意的事项 载体和外源DNA插入片段的连接结果一、粘性末端的连接DNA连接酶把相互靠近的5’端磷酸与3’-OH连到一起。1. 两段DNA的连接依靠粘性末端2. DNA片断与载体的连接1)同种酶产生的粘末端连接-插入 正反向插入 载体、外源基因自我连接 载体和外源基因混连ligasenick2)定向连接-置换用产生不同粘末端的两种限制性酶消化载体与外源DNA 避免了载体和插入分子自我连接 以固定方向重组 有些载体的粘末端形成少量碱基互补,形成开环二、平末端(blunt end)的连接1. 直接连接5’端与3’端并列靠近的时间太短,不容易被连接酶连接。T4DNA连接酶虽然能连接平末端,但效率很低,只有粘性末端的1%-10 % 。5’ 5’ P--OH3’ P--OH3’ HO-HO--P3’ -P3’ 5’ 5’ 5’ P--OH3’ -PHO-3’ 5’ 2. 获得平末端的方式(1)用产生平末端的内切酶切割 载体和外源DNA5‘ … G-C-T-C-A-G-C-T-G-G-A-G … 3’3‘ … C-G-A-G-T-C-G-A-C-C-T-C … 5’PvuII 37 ℃5‘ … G-C-T-C-A-G-OH P-C-T-G-G-A-G … 3’3‘ … C-G-A-G-T-C-P OH-G-A-C-C-T-C … 5’(2)用Klenow聚合酶补平或S1核酸酶切平获得 Klenow酶拥有5‘→3‘的DNA聚合酶活性 S1核酸酶的基本反应:内切带缺口或缺刻的双链DNA或RNA3. 人工加尾形成 “粘性末端” (1)同聚加尾法 1972年,斯坦福大学的P. Labban和P. Kaiser提出。①原理:DNA末端转移酶(TdT)能在没有模板的情况下给DNA的3’-OH端加上脱氧核苷酸。②平末端变为3’突出末端用5 ’特异核酸外切酶或能产生3 ’突出末端的内切酶消化。③加尾—碱基互补分别给载体和插入片断加上互补的核苷酸。③优点:能把任何片段连接起来,且避免载体和外源DNA自身环化④缺点:不能把插入片段再切下来。非酶切位点(2)衔接物(linker)连接① linker用化学合成法合成的一段10-12bp的具特定限制性内切酶识别位点序列的平端双链。GGAATTCC CCTTAAGGEcoRI linker:② linker的作用用T4 DNA连接酶连到平端DNA上,然后再用酶切,形成一个人工粘性末端。 ③优点:1)可以用内切酶把插入片段切下来。2)能给载体连接上Polylinker④缺点:如果插入片段内部也有该酶位点,不能切下完整的插入片段。(3)DNA接头 (adapter)连接法1978年康内尔大学的吴瑞教授发明。① adapter一头平末端、另一头粘性末端(某种酶切位点序列)。5‘p-GATCCCGG-OH3’ GGCC-p5’ BamHI adapter② adapter的作用用T4DNA连接酶连到DNA分子的两端,直接成为人工粘性末端。P-5’p-GATCCCGG-OH3’ HO-GGCC-p5’ -PBlunt-ended DNABamHI adapterT4DNA连接酶5‘p-GATCCCGG- GGCC--CCGG -GGCCCTAG-P5’ CCGG GGCCCTAG-P5’ 5‘p-GATCCCGG- GGCC-接头自我连接CCGGGATCCCGG-OH GGCCCTAGGGCC-P5’ ③优点:连上后就能用。④缺点:接头与接头会彼此以粘性末端接在一起,影响与DNA片段的连接。⑤防止自我连接先用小牛肠碱性磷酸酶(CIP)处理接头,水解掉其5’端的磷酸,防止自我连接。 (以后再用T4多核苷酸激酶加上磷酸。) P-CCGG-OH HO-GGCCCTAG-P5’ 5‘p-GATCCCGG-OH HO-GGCC-PCIP处理 5’CCGG-OH HO-GGCCCTAG5’ 5‘GATCCCGG-OH HO-GGCC5’ -OH CCGGGATCCCGG-OH HO-GGCCCTAGGGCC5’ HO-接头之间不能形成磷酸二酯键自我连接!5’p-GATCCCGG-OH3’ HO-GGCC-p5’ BamHI adap

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