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2019-07-03 发布于湖北
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MedeA-Docking——分子对接工具 MedeA-Docking能够创建，修改和细化主-客体体系结构。MedeA-Docking 利用著名的Metropolis蒙特卡洛算法，快速估计范德华作用，生成并筛选出稳定的体系构象。获得的主-客体结构可以直接应用于力场和第一性原理计算模拟。此模块能够在MedeA 图形界面中或MedeA 的Flowchart 中交互调用。 MedeA-Docking 的关键优势：  加速模型的构建和细化  能够自动应用MedeA-Flowcharts进行模型建立和筛选  为分子动力学或第一性原理计算模块提供初始模型 MedeA-Docking 的主要功能：  自动组合主体和客体结构并进行筛选和模拟  预估空间作用  根据自动确定的能量精确吸附物的位置与方向源资信息科技（上海）有限公司热线电话：4006-818-600  在对接过程中，界面屏幕交互式更新且用户能够完全控制模型的查看模式和比例。  能够控制模拟时长，蒙特卡洛温度，最大位移和最大旋转角度  能够组合多种吸附物与主体结构  采用Metropolis蒙特卡洛算法，用户可控制搜索标准（设置温度控制接受概率）  可用于表面、微多孔和多孔材料模型所需MedeA 模块：  Welcome MedeA Bundle  MedeA-Forcefield 支持MedeA 模块  MedeA-LAMMPS  MedeA-LAMMPS-EAM  MedeA-LAMMPS-Diffusion  MedeA-VASP  MedeA-TSS 源资信息科技（上海）有限公司热线电话：4006-818-600