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- 2019-03-06 发布于天津
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乙型肝炎病毒基因分型与TaqMan-MGB荧光探针方法改进
郑卫东1, 胡菊2?
(1.湖北医药学院附属人民医院检验部,湖北十堰442000
2.十堰职业技术学院生化和环境工程系,湖北十堰 442000)
[摘要] 目的 改进对乙型肝炎病毒(HBV) S基因TaqMan-MGB型特异性荧光探针设计,使探针序列与非本型靶基因核苷酸靶序列,有2-4碱基不互补,以此提高TaqMan-MGB型荧光探针特异性,建立一种快速准确的实时PCR检测乙型肝炎病毒基因型方法。方法 根据HBV基因型A~H的全序列 ,在S基因区设计引物和型特异性TaqMan-MGB探针,建立实时PCR检测HBV基因型方法,并检测88例CHB患者的 HBV基因型,同时对扩增的PCR产物,进行核苷酸序列测定,应用统计学方法对两者进行比对。结果 CHB血清样本中HBV以基因型B和C为主、基因型A、B、C、B+C、D样本比例分别为2.3%、45.5%、35.2%、12.5%、2.3%,未检测出其它基因型,S基因测序结果与本分型法完全一致。结论 应用改进TaqMan-MGB探针建立的实时荧光PCR HBV基因分型法和目前PCR扩增后测序、限制性内切酶酶切后电泳或核酸杂交相比,更能简便、灵敏、快速、准确地鉴定 HBV基因型。
[关键词] 肝炎病毒;基因型;聚合酶链反应;TaqMan-MGB探针
HB
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