乳癌相关转录子之预后特征.PDF

乳癌相關轉錄子之預後特徵 由預測之調控機轉建議其對預後的影響由預測之調控機轉建議其對預後的影響 臺大婦產科 章麗雲博士 在科學日新月異之近十幾年中，高數據產量之生物晶片技術 逐漸成熟且電腦驅動的分析方法不斷精進逐漸成熟且電腦驅動的分析方法不斷精進 。隨之而來的隨之而來的 ，，一羣科學羣科學 家們藉著這樣的助力，積極地將生命科學的研究模式，注入系統生 物學的新研究模式。這個新模式意味著將原來的研究模式，加入了 〝系統化〞的元素。因此，它的近程目標是，以一個假設為探討起 點，設計實驗去發現並證實大量系統性生物資訊的意義，以補足傳 統研究未能探討之課題。可預期的長遠目標是，它將加速提昇吾人 對生命科學的瞭解，進而提出更多的假說以供深入研究。目前國際 醫療趨勢偏向個人化醫療，引進系統生物學的新研究模式，將對個 人化醫療之研究有助益。 6 以乳癌生物晶片基因表現所建立轉錄子調控之網狀圖為例，在國 科會經費補助、台大醫院病歷室及倫委會之協助下，我們的研究團隊、 台灣大學及國外大學學者們，已共同研發出一套系統化有監控之統計 模式網絡分析法模式網絡分析法 。由於我們的研究由於我們的研究 ，主要利用乳癌生物晶片基因表現主要利用乳癌生物晶片基因表現 層面上之數據，予以系統化深入探討，故歸屬於系統生物化學領域。 它是系統生物學不可或缺的一部份。 我們已陸續建立乳癌相關轉錄子調控之網狀圖，且預測其對預後、 病理及生物學的意義(圖一)。根據我們近期的研究顯示，在轉錄子調控 之網狀圖中之網狀圖中 ，少數與病理相關的基因少數與病理相關的基因 ，同時也是預測對癌症治療反應同時也是預測對癌症治療反應 與否之決定因子。並且，僅在一小羣乳癌檢體中，可以找到這些基因 一致性的表現，且可能是被一或多個轉錄子調控。再經由數據分析， 證實這組基因之特殊表現型式，顯著地對預後有關鍵性的意義。重要 的是，已有不少他人研究成果支持我們的發現。其中之一例是，我們 發現轉錄子發現轉錄子 STAT3STAT3 在在一小羣雌激素受體小羣雌激素受體((ERαERα))陽性的乳癌陽性的乳癌 ，，具有不良具有不良 預後特徵。這轉錄子調控這組基因(預後相關之基因標記組)之機轉，可 能分別經由ERα-STAT3 ，MYC-STAT3 ，ERα-MYC-STAT3 共同調控 及STAT3 單–調控所致。因此，若進一步用實驗，以找出轉錄子調控 這組基因之詳盡機轉，將可預期發展出新的治療方針，以助改善這一 小羣乳癌病人的存小羣乳癌病人的存活率率 。此外此外 ，若若一個乳癌檢體個乳癌檢體 ，通常擁有通常擁有一個或多個或多 個轉錄子可能與預後相關，則由我們的研究成果延伸出一項假說：乳 癌病人檢體，可用其具有的預後相關之基因標記組之數量，予以進一 步分類。如此，將有助於提昇個人化醫療的效率。 根據181 套乳癌生物晶片之基因表現數據，我們初步找到149 個轉 錄錄子子((包含轉錄子包含轉錄子 ，其轉錄變異體或其亞單位其轉錄變異體或其亞單位))可能可能與預後相關與預後相關 。其中其中 過半數(81/149)可以歸類在六大轉錄子家族-ETS, FOX, HOX, KLF, NR 及SOX 。這些轉錄子家族成員，也是調控胚胎發育之重要調節子。因 此，我們未來將探討孕激素對乳癌細胞 中六大轉錄子家族成員們所造 成之影響。進而找出其對妊娠相關乳癌預後的意義，以期有助於改善 妊娠相關乳癌病人的存活率妊娠相關乳癌病人的存活率 。。 關鍵字: 生物晶片技術;電腦驅動的分析方法;有監控之統計模式網絡分 析法;轉錄子調控之網狀圖; 預後相關之基因標記組；調控機轉;存活率; 乳癌;妊娠相關乳癌。 7 圖一、有監控之統計模式網絡分析法簡單流程圖及其輸出結果的例子。 •小圖A 展示將預先設計之病人檢體生物晶片數據組，進行一系列分析， 步驟中包括運用我們已研發的統計方法，分析出具顯著性(p≦0.05)單 變量的關連(univariate association)及多變