基于3D＋slicer的医学影像分割算法及其实践应用探究.pdfVIP

ELECTRONICS WORLD 探 索与观察 ・ 基于3D slicer的医学影像分割算法及其应用研究 新乡医学院生物医学工程学院 河南省人民医院放射科 杨慕艺 【摘要】 医学图像分割是医学影像图像处理的重要部分，实现图像快速而精确的分割对临床诊断和治疗以及后续处理有很重要的意义。 3D-Slice是一个开源的可视化和图像分析软件，可基于3大系统平台使用，目前最新版本为Slicer4。其中包含了很多丰富的图像分割的算法和 操作。区域增长法、多对象分割算法以及EM算法是其中应用较广的分割算法。研究了这三个算法本理论及其在图像分割上的应用和实现， 分析了他们的特点和应用范围。 【关键词】 图像分割区域增长法；EM分割算法；多对象分割 2.3 特点 1 3D Slicer简介 （1）优点 1）区域生长方法，能够正确区分我们定义的具有相同属性的 3D Sl i c er 是一个免费的开源软件包 ，主要应用于医学影像 的区域。 图像的分析和可视化研究。它的应用平台非常广泛，可 以基于 2 ）区域生长的方法所分割出的结果具有有清晰的边缘。 windows、Linux和Mac OsX等系统平台使用，Slicer 的代码主要由 3 ）原理简单，只需要一些简单的参数，用数字来代表所需的 C++设计，并且它是基于ITK和VTK 的设计，也包含一些Python 、 种子点，然后进行区域的增长，来实现像素的聚类，最终达到分割 Tcl、Matlab等代码。 的目标。 3Dslicer 的主要特点是： 4 ）可以自主的断则种子点和增长的标准。 （1）多图像格式：包括， （netCDF 、HDF 、BMP 、DICOM 、 5 ）对噪声较少的图像有较好的分割效果。 DIB 、JPG、PICT 、TIFF 、CLP 、EPS、WMF等），图像格式之间 （2 ）缺点 可以相互转换，这个过程的实现是在滤波模块中实现的。 1）计算耗时。 （2 ）多个功能模块 2 ）噪声强度的变化可能导泄露或者过分割。 （3 ）Slicer 的各种功能以可以动态加载的module为单位进行组 3 ）这种方法可能无法分辨真实图像的阴影，无法分辨伪影。 织，目前Slicer支持3种module ，开发者需要选择其中一种作为原型展 开开发，对于使用者而言，三种module是没有区别的。对Slicer 的内部 3 多对象分割 访问受限，这是这三种模块的区别，每种模块对于slicer 内部访问的权 限是不同的，开发者根据 自己模块的需要选择使用哪种模块。 3.1 算法原理 首先，通过使用者标记的种子点，用稳健统计数据来描述对象 2 简单的区域增长法 的特征[4,5] 。第二，借用机械学衍生出的简单原理，通过一些活动 的轮廓同时通过彼此间的相互作用进行演化，这不仅保证了轮廓间 2.1 算法原理 的排他性，使得轮廓平衡地汇聚到所给对象所需的位置上。 首先计算所有包含在区域内像素强度值的的均值和标准方差， 通过竞争，从两边到达决定边界，而不是从一个单一的方向阻 用一个因子f乘以标准方差，来定义均值的一定范围。如果相邻像 止泄露。因此，用牛顿力学的基本原理来控制之前单独演化的边界 素的强度值落在这个范围内,就将其包含在区域内