肺炎链球菌的检测与分型技术.pptVIP

基于分子特征 肺炎链球菌分型技术-脉冲场分型 PFGE Typing SOP 《我国部分地区肺炎链球菌血清分型与脉冲场凝胶电泳分型分析 》：《中国疫苗和免疫》2010年第03期 基于分子特征 MLVA：Multiple-Locus variable number tandem repeat Analysis 细菌基因组中广泛分布的短重复序列（repetitive sequence），它们在菌株、种、属水平上分布有差异及进化过程有相对保守性。 VNTR-PCR：即细菌基因组重复序列PCR技术；是扩增细菌基因组中广泛分布的短重复序列，通过电泳条带比较分析，揭示基因组间的差异。 基于分子特征 基于分子特征 方法 原理/靶位点 优势 缺点 PFGE 全基因限制性多态性 相对较高的分辨率 适用于爆发流行研究 需要特殊技术 速度慢 得到的是条带信息 实验室间比对受限 易受其他因素影响 MLST 测序确定管家基因等位变异 可进行菌株种系分析 序列信息 可实现实验室间对比 标准化的命名系统 分辨率有限 通量低 花费高 MLVA 染色体内的重复序列多态性 快速 高通量 分辨率有限 尚需验证的分型体系 无标准命名体系 适用范围 传统的血清分型：分型金标准 PCR分型（荧光PCR）：大量菌株型别初筛 MLST：耐药克隆或致病克隆的追踪 PFGE：爆发溯源 MLVA：进化或微进化研究 肺炎链球菌