广西鹅圆环病毒全基因组序列测定.pdfVIP

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2019-04-07 发布于浙江
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广西鹅圆环病毒全基因组序列测定.pdf

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ofSouthern 南方农业学报Journal 2016，47(1)：122—127 Agriculture ISSN2095—1 NNXAAB 191；CODEN DOI：10．3969／j：issn．2095-1191．2016．01．122 广西鹅圆环病毒全基因组序列测定曹慧慧1，一，孙文超1，郑敏，韦显凯2，苏姣秀2，蒙振亩3，黄宝学4，刘棋2 控制中心，广西百色533000；4田东县动物疫病预防控制中心，广西百色533000) 摘要：【目的】解析鹅圆环病毒(GooseCircovims，GoCV)广西流行毒株的全基因组序列及其遗传进化地位，掌握广西GoCV的流行情况，为今后更有效防控GoCV提供理论依据。【方法】分3段对阳性组织样品中的GoCV全基因组进行PCR扩增、克隆和测序，并对拼接得到的GoCV广西流行毒株全基因组进行核苷酸组成、基因组结构及遗传变异分析。【结果】GoCV广西流行毒株(GXTD254)全基因组长度为1822nt，编码4个主要开放阅读框：ORFVl(Rep蛋白， 293个氨基酸)、ORFV2(37个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白。250个氨基酸)和ORFC2(99个氨基酸)，且Rep蛋白较Cap 论】目前我国流行的GoCV存在多个分支，广西流行毒株与部分浙江分离毒株在亲缘关系上比较接近。关键词：鹅圆环病毒；全基因组；序列分析；Rep蛋白；Cap蛋白中图分类号：$858．33 文献标志码：A J～● ●』-J～ - Genome of C：!ircoyJrUSlrom sequencinggoose Guangxt CAO Hui—huil，2，SUNWen—cha01，ZHENGMin2+，WEIXian—kai2，SUJiao—xiu2， MENG Zhen—mu3，HUANGBao—xue4，LIU Qi2 DiseasePreventionand CenterforAnimalDiseasePreventionand 530001，China；3Baise Control，Baise， Control，Nanning CenterforAnimalDiseasePreventionand 533000，China) Guangxi533000，China；4Tiandong Control，Baise，Guangxi and statusof evolutionary Circovims(GoCV)inGuangxi Abstract：【Objective】Thegenomesequencegenetic goose were tounderstand orderto theoreticalbasisforeffective andcontrol situation，in investigated epidemic provide prevention of