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增 刊 原 子 与 分 子 物 理 学 报 Supplement
2004年 4月 JOURNALOFATOMICANDMOLECULARPHYSICS Apr.,2004
文章编号:i000—0364(2004)增刊一0007—04
基于电子动量谱学的正戊烷分子构象分析
肖 琦 ,庞文宁 ,黄 铭 ,刘义保 2
(1.清华大学物理系极化物理实验室,北京,100084;2.东华理工学院物理系,江西抚州,344000)
摘要:本文对正戊烷(n.p朗tane)分子构象进行了理论研究,给出了不同构象分子价轨道的能级分布和电子
动量分布,进而分析引入电子动量谱学(EMs)作为一种新的实验探测手段,把电子动量谱学推向有机分子
构象研究领域。
关键词:正戊烷分子;构象;电子动量分布;量子化学计算
中图分类号:O561 文献标识码 :M
1 引言
构象属于分子几何结构的一个基本层次,它对有机化合物的性质、稳定性和反应机理都有重要的影
响。目前国内外对生物分子的构象模拟及以此为基础的结构、功能方面的研究极为关注,投入了大量的科
研力量,并且取得了丰硕的成果u.2J。但迄今为止,分子构象的起因及变化仍然面临许多挑战性的问题,
所以一方面还需要采用现有的探测手段进行深入研究,另一方面发展新的探测手段。已有的分子构象探
测手段,有化学方法、分子生物学方法及各种物理实验方法(如核磁共振谱(N )、红外光谱(IR)、荧光光
谱 (Fs)、激光拉曼光谱(Raman)、原子力光谱(A ,I)、圆二色谱(CD)、气相色谱(GC)、电子衍射、x射线晶
体衍射等等);近年来随着计算机的发展,计算机模拟也已成为重要手段之一。不久前,Deleuze和Pang
(2001)等人研究发现分子构象变化可能引起成键轨道电子密度分布的变化,而这些变化用电子动量谱学
方法可观测到,他们仔细分析了正丁烷 (n.Butnae)的电子动量谱实验数据,首次明确提出用基于(e,2e)
散射实验的电子动量谱学作为分子构象分析的探针[3.4]。本文据此对正戊烷 (n.pentnae)分子进行构象计
算和分析,使用的计算软件为Guassina98,计算方法为Hartree.Fock方法和密度泛函理论(DFT)。
2 计算和分析
2.1 正戊烷分子构象
计算表明正戊烷 n.pentnae)存在四个稳定的分子构象,它们都为具有能量极小值的交叉式:构象A,
trnas-trnas(TT)结构,具有 C2y对称性;构象B,trnas-guache(TG)结构,为 C1对称性;构象 C,guache-
guache(G G )结构,具有 C2对称性;构象D,也是guache-guache(G G一)结构,为 C1对称性。
从图1可以看到构象A分子的空间结构为一交错的直链,构象B分子与构象A分子的差别在于由于
绕C-一C键的旋转,造成正戊烷分子一端的甲基相对位置的改变;构象 C分子相对于构象A分子,则是两
端的甲基位置都发生扭转,并且两甲基位置异侧;而构象D分子相对于构象A分子也是两端的甲基位置
都发生扭转 ,只不过两甲基位置同侧。
·基金项目:中国科技部与比利时弗拉芒大区科技合作项 目,国家 自然科学基金资助项 目。
作者简介:肖琦 (1977一),男,汉,浙江人,清华大学物理系硕士研究生,原子分子物理研究方向。
8 原 子 与 分 子 物 理 学 报 2004钷
● 2 4 6 7 8
构象A 构象B 构象 C 构象 D
图 1正戊烷分子的四种构象
正戊烷分子的四种构象,在不同的温度条件下,它们
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