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Western blot 实验技术 牛君星 定义: 印迹法(blotting)是指将样品转移到固相载体上,而后利用相应的探测反应来检测样品的一种方法。 Western Blot是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法。 1975年,Southern建立了将DNA转移到硝酸纤维素膜(NC膜)上,并利用DNA-RNA杂交检测特定的DNA片段的方法,称为Southern印迹法。 而后人们用类似的方法,对RNA和蛋白质进行印迹分析,对RNA的印迹分析称为Northern印迹法,对单向电泳后的蛋白质分子的印迹分析称为Western印迹法,对双向电泳后蛋白质分子的印迹分析称为Eastern印迹法 Western Blot基本原理 Western Blot:采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物 是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。 经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。 Western Blot一般流程 蛋白样品的制备 SDS聚丙烯酰胺 凝胶电泳 电泳 转膜 封闭 一抗杂交 洗涤 二抗杂交 洗涤 底物显色 通过有机溶剂或水溶法制备总蛋白 水溶液提取法 针对水、稀盐、稀酸或碱溶液中的蛋白质。稀盐和缓冲系统的水溶液 对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂 。 细胞裂解液: 0.5ml水+0.5ml裂解液+10μl蛋白酶抑制剂+ 10μl 泛酸钠+ 1μl pepstain 有机溶剂提取法 对于分子中非极性侧链较多的蛋白质可用有机溶剂提取,包括乙醇、 丙酮和丁醇等。 通过层析或电洗脱法制备目的蛋白 蛋白样品的制备 细胞数量达5×106个时就可以做WB。 将细胞裂解液再离心,收集上清液,加loading煮样5min 蛋白样品制备的注意事项: 煮沸5-15min,以充分变性蛋白,保证蛋白从空间结构变为一级结构(多聚体解散为单聚体,氧化状态转化为还原状态等)。有的也可以在700C加热5-10min,尤其适用于多次跨膜蛋白的检测(这些蛋白在煮沸状态下容易聚集,而聚集状态则会影响标本进入凝胶的效率。) 纯净水(ddH2O) 丙烯酰胺和N,N’-亚甲双丙烯酰胺 (Arc-Bis)。30%(29:1) SDS(10%) Tris-HCL 四甲基乙二胺(TEMED)(催化硫酸铵形成自由基而加速丙烯酰胺和双丙烯酰胺的聚合) 过硫酸铵(APS)(提供引发丙烯酰胺和双丙烯酰胺聚合的自由基) 凝胶成份 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳注意事项: 做胶:防止漏胶、进气泡以及花胶(水封、插梳子和拔梳子)。 加样:两边加loading,加样量一样,加样时间要尽量短,以免样品扩散 电泳:将胶夹好放于电泳槽中,加电泳buffer(内外面不能联通),将电压调到90V开始电泳,待marker开始分离时将电压调到120V,直到溴酚兰前沿跑出胶后停止电泳。 膜的选择 转膜注意事项(一) 泡膜: 转膜之前将海绵、胶、膜都用预冷的转移buffer浸泡20min (1.凝胶若是没在预冷的转膜buffer中浸泡,就会在转膜过程中出现凝胶皱缩,导致出现转移条带变形。2.PVDF膜具有疏水性,需用甲醇浸泡) 转膜顺序: 阴极碳板+海绵+三滤+胶+膜+三滤+海绵+阳极碳板 转膜条件: 0.35A 250V 1h40min 冰浴中进行转膜 (具体转膜时间要根据目的蛋白的大小而定;目的蛋白的分子量越大,需要的转膜时间越长,反之则短。) 转膜的注意事项(二) 避免直接用手碰杂交膜,使用镊子。因为手上的蛋白和油脂会影响转膜效率并会使膜脏掉。 夹好膜和凝胶后,确定在凝胶/膜和滤纸之间没有气泡存在,否则会导致转膜不完全。 保证膜和滤纸的大小和凝胶完全一样,过大和过小都会影响转膜效率。 鸡来源的抗体与PVDF和尼龙膜有较强的结合能力,从而产生较高的背景,故如果选择鸡来源的抗体最好使用硝酸纤维素膜(NC膜)。 封闭(30min)(封闭时间过短会导致背景过深 ) 5%脱脂奶粉(如果用生物素标记的二抗,就不能用奶粉封闭,因为奶粉中含有生物素 ) BSA(牛血清蛋白) Western Blot 膜封闭液(谷歌生物提供) 一抗、二抗孵育 加入一抗溶液孵育(抗体浓度过高会导致背景较深,过低会导致和抗原结合不充分,出现假阴性 )。4 ℃时过夜。 回收一抗溶液,用TBST
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