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细菌启动子的性质 启动子通常由转录起始点上游40bp长的序列组成 包括两段一致序列: “-35 区”—— 一致序列是TTGACA Pribnow盒或“-10 区”——一致序列是TATAAT “-35”区和“-10区”之间的间隔序序列的性质不重要,但长度重要,一般为17±1bp。 “增效元件”——发现在某些转录活性超强的rRNA基因的上游-40和-60之间的区域,富含AT的启动子序列,可将转录活性提高30倍。 如果一个基因的启动子序列与一致序列越相近,则该启动子的效率就越高,为强启动子;反之,就是一个弱启动子。 细菌和真核生物在转录上的差别 染色质和核小体结构对转录有深刻的影响 真核细胞RNA聚合酶高度分工 转录还需要许多被称为转录因子的蛋白质的参与 启动子以外的序列参与调节基因的转录 转录与翻译不存在偶联关系 转录的产物多为单顺反子,而原核基因的转录产物多为多顺反子 各种顺式作用元件 增强子 沉默子 绝缘子 应答元件 古菌的DNA 转录 与复制系统相比,古菌似乎拥有简版的真核转录系统。无论是催化转录的RNA 聚合酶的结构和性质,还是启动子的结构以及转录的基本过程都与真核生物极为相似。然而,在基因表达的调控方面,古菌与细菌接近。 在启动子的结构上,古菌类似于真核生物由RNA 聚合酶Ⅱ所负责转录的基因,一般由三个部分组成:一是位于转录起点上游的TATA 盒,它由TBP 识别;二是位于TATA 盒上游的BRE,它由TFB 识别;三是位于转录起点的起始子元件(Inr) 四、转录后加工 核苷酸修饰:碱基修饰和核糖修饰 剪切 剪接:顺式剪接、反式剪接和选择性剪接(可变剪接) 添加核苷酸:加帽和加尾 编辑 细菌mRNA前体的后加工 在细菌,mRNA很少有后加工。但某些噬菌体mRNA会发生最简单的剪切反应,将一个多顺反子切割成单顺反子,也有某些噬菌体的mRNA需要经过相对复杂的剪接反应才能成熟(如T4噬菌体编码的胸苷酸合酶)。 真核细胞mRNA前体的后加工 加工形式 1) 5′-端 = 加帽 2) 3′-端 = 加尾 3) 内部 = 剪接 4) 内部=甲基化 5) 编码区=编辑 后加工机制 加帽和甲基化 帽子结构 加帽反应:共转录 功能 mRNA前体的剪接 剪接这种后加工方式是在发现基因断裂的现象后确定的。1977年,由Phillip Sharp和Richard Roberts领导两个实验小组几乎同时在腺病毒的晚期表达基因中发现蛋白质基因断裂现象。 进一步研究表明,基因断裂是真核细胞及其病毒的基因组中的普遍现象,在高等生物的基因组中,只有很少的蛋白质基因是连续的(如组蛋白和干扰素),但在低等的真核生物,断裂基因却不多见。 不同断裂基因含有的内含子数目不一定相同,同样内含子大小也会有差别。一般说来,一个典型的真核生物蛋白质的基因由10% 的外显子序列和90%的内含子序列组成。 变性 与成熟的mRNA杂交; 在电镜下观察 R-环技术:真核基因内含子数目与结构分析 DNA 模板链 成熟的mRNA R环实验的结果及其对结果的解释 mRNA前体的剪接机制 mRNA前体的剪接是高度精确的。其精确性一方面取决于位于外显子和内含子交界处的剪接信号(可以将其视为内因),另外一方面取决于5种被称为snRNP的核糖核酸蛋白质复合物(可以将其视为外因)。 剪接反应的“内因”——剪接信号 剪接反应的“外因”——snRNP和剪接因子 剪接反应——两次转酯反应 可变剪接和反式剪接 可变剪接 一种mRNA前体可以通过去除不同的内含子/外显子组合而剪接成两种以上的mRNA,从而导致一个基因可以编码多种蛋白质 果蝇的性别决定与可变剪接有关 反式剪接 发生在两个mRNA分子之间的剪接 比较罕见 自然界只发现在锥体虫和秀丽线虫 果蝇的性别决定与可变剪接 mRNA前体的编辑 定义 任何发生在转录后编码区内的序列变化 主要类型 1) 尿苷酸的插入 2) C→U (哺乳动物的Apo B-48) 3) A→I (哺乳动物谷氨酸受体的一个亚基) 机制 1) gRNA 2) 特殊的脱氨酶 意义 1) 提高遗传信息的容量 2) 创造终止密码子和起始密码子 rRNA前体的后加工 细菌-剪切、修剪和修饰 真核生物 1)剪切、修剪和修饰 (需要snoRNA) 2)剪接 (某些真核生物,如四膜虫) tRNA前体的后加工 细菌 1) 剪切和修剪 2) 修饰 3) 添加CCA (如何需要) 真核生物 1) 剪切和修剪 2) 修饰 3) 添加CCA 4) 剪接(某些真核生物) 五、翻译 参与翻译的主要生物大分子 翻译的
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