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- 约8.21千字
- 约 127页
- 2019-06-02 发布于浙江
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第三章 转录及其调控;遗传信息由DNA转换到RNA的过程。
蛋白质生物合成的第一步,合成mRNA以及非编码RNA(tRNA、rRNA等);多核苷酸链的合成都是以5’→3’的方向.
转录特点:
(1)对于一个基因组来说,转录只发生在一部分基
因,而且每个基因的转录都受到相对独立的控制
(2)转录是不对称的
(3)转录时不需要引物,而且RNA链的合成是连续的。;一、所需因素;2.RNA聚合酶(RNA polymerase)
RNA聚合酶有以下特点:
(1)无需引物的存在能独自起始新RNA链
的合成
(2)没有校对能力;
(3)催化的底物是核糖核苷三磷酸。
; 大肠杆菌只有一种RNA聚合酶,负责所有rRNA、mRNA和tRNA的合成。该酶具有全能性,基本上不需要其他蛋白因子的参与,即可独立的进行。
功能:
(1)识别DNA双链上的启动子
(2)通过阅读启动子序列,确定转录方向和模板链
(3)解开DNA部分双螺旋,产生约17 bp的单链DNA模板
(4)选择正确的核糖核苷三磷酸(rNTP)底物并催化形成磷
酸二酯键,使合成的RNA链不断延伸。
(5)最后当它达到终止子时,识别转录终止信号,停止转录。;结构:
5种亚基组成:两个α亚基、1个β亚基、1个β′ 亚基
和1个δ亚基。
转录的起始阶段:
δ亚基和核心酶( α2ββ′)组装成全酶共同起作用。δ亚基无催化活性,但它能识别启动子并将封闭的启动子复合物转换成开放状态。
一旦转录起始,δ亚基就从全酶上脱离下来。核心酶与模板DNA结合的亲和力弱,特异性差,这有利于它在模板链上移动,促进转录延伸。
;σ因子负责识别启动子的保守序列,不同的σ因子识别不同的启动子。
许多细菌能产生多种可取代的σ因子,以识别不同的启动子。;大肠杆菌只有一种RNA聚合酶,负责所有rRNA、mRNA和tRNA的合成。并且该酶具有全能性,基本上不需要其他蛋白因子的参与,即可独立的进行转录的起始、延伸和终止。;一些抗生素,如利链菌素,可以抑制原核生物的RNA聚合酶,使得原核生物的基因无法转录成mRNA,从而达到杀死细菌等原核生物的效果。
;1.转录起始
1)全酶与模板的DNA接触,生成非专一的,不稳定的复合物在模板上移动。
2.起始识别:全酶与-35序列结合,产生封闭的酶-启动子二元复合物。
3.全酶紧密地结合在-10序列处,DNA模板局部变性,形成开放的启动子二元复合物。(RNA聚合酶与启动子结合后造成约10bp的DNA解链)
4.合成短多聚核苷酸(10nt),三元复合物形成。(酶-启动子-NTP)
5. σ因子从全酶中解离下来,聚合酶转变为延长构型。酶分子与启动子特异性结合性的结合力下降,延伸阶段开始。
;转录延长;三、转录的终止;不依赖ρ因子终止作用:
在转录终止点之前有一段回文序列,回文序列的两个重复部分之间由几个碱基对的不重复阶段隔开;依赖于ρ因子终止作用
ρ因子是55KDa蛋白,其活性形式为六聚体
1)促进转录终止活性
2)NTPase活性,需要RNA链。
;转录单元是一段被转录成单链RNA的DNA序列,它起始于启动子,结束于终止子。
一个转录单元可能包含不止一个基因。
;一、所需因素
转录起始需要启动子,RNA聚合酶和转录因子参与。
1.转录起始前的上游区具有启动子核心序列。不同物种、不同细胞或不同的基因转录起始点上游有不同的DNA序列,统称为順式作用元件(cis-acting element).
順式作用元件包括启动子、启动子上游元件等近端调控元件和增强子等远隔序列。;起始点上游多数有共同的TATA序列,称为TATA盒。(启动子核心序列)
启动子上游元件是位于TATA盒上游的DNA序列,多在转录起始点约-40~-100nt的位置,常见的是GC盒和CAAT盒。
增强子-能够结合特异基因调节蛋白,促进邻近或远隔特定基因表达的DNA序列。;2. 真核生物有三种DNA依赖RNA聚合酶;真核生物转录起始十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助。
能直接、间接辨认和结合转录上游区段DNA的蛋白质,已发现数百种。统称为反式作用因子(trans-acting factors)
反式作用因子中,直接或间接结合RNA聚合酶的称为 转录因子(transcriptional factors,TF).;真核生物RNA聚合酶不与DNA分子直接结合,而需依靠众多的转录因子,形成转录起始复合物(pre-initiation complex,PIC).;第一类为普遍转录因子它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合物,转录才能在正确的位置开始。TFⅡD,TFⅡA,TFⅡF,TFⅡE
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