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第二代测序的基本数据处理 杜政霖 duzhl@ “基因组科学与信息”培训研习班 “基因组科学与信息”培训研习班 1. 基本数据处理 • Resequencing – Reads mapping – SNP, Indel, Structure variations – Exon capture: Nimblegene, SureSelect • de novo sequencing – Reads assembly – Genome/Transcriptome “基因组科学与信息”培训研习班 2. 第二代测序平台数据 • illumina Genome AnalyzerII (solexa) – Reads length: 80-12