3-基因、基因组和基因组学.pptVIP

* * 模式生物体的基因组测序 意义： 可以为人类基因组的研究进行技术的探索和经验的积累； 有助于人们在基因组水平上认识进化规律； 可以通过对不同生物体中的同源基因的研究，以及利用模式生物体的转基因和基因剔除术（knockout）等方法研究基因的功能。 * * 人类基因组的测序 1998年，由PE公司和TIGR合作成立的Celera公司宣布将在3年时间内完成人类基因组全序列的测定工作，建立用于商业开发的数据库，并对一大批重要的人类基因注册专利。面对私营领域的挑战，公共领域的测序计划也加快了步伐。 * * 2000年6月25日，美、英、日、法、德和中国的16个测序中心或协作组获得了占人类基因组21.1％的完成序列及覆盖人类基因组65.7％的工作草图，两者相加达到86.8％。同时，对整条染色体的精细测序也获得突破性进展。1999年12月，英、日、美、加拿大和瑞典科学家共同完成了人类22号染色体的常染色体部分共33.4 Mb的测序。 * * 2001年2月15日，国际公共领域人类基因组计划和美国的Celera公司分别在“Nature”和“Science”杂志上公布了人类基因组序列工作草图，完成全基因DNA序列95％的测序。2003年4月14日，国际人类基因组测序共同负责人Francis Collins博士宣布，人类基因组序列图绘制成功，全基因组测序完成99％。 * * 二、功能基因组学 人类功能基因组学涉及众多的新技术，包括生物信息学技术、生物芯片技术、转基因和基因敲除技术、酵母双杂交技术、基因表达谱系分析、蛋白质组学技术、高通量细胞筛选技术等等。以解决有关基因功能研究中的基本问题：基因何时开始表达；基因表达产物定位于何处；该基因将与其它哪些基因相互影响；该基因如出现突变将会导致什么后果等 * * 1、蛋白质组学 是对蛋白质性质和功能的大规模研究，包括对蛋白质的表达水平、翻译后修饰以及与其它分子的相互作用的研究，从而可以得到细胞进程在蛋白质水平上的宏观映象。蛋白质作为mRNA的产物在细胞中行使着大部分的功能，但是蛋白质水平与mRNA水平之间并不一定有严格的线性关系。 * * 实验证明，组织中mRNA丰度与蛋白质丰度的相关性并不好，尤其对于低丰度蛋白质来说，相关性更差。蛋白质复杂的翻译后修饰、蛋白质的亚细胞定位或迁移、蛋白质-蛋白质相互作用等都几乎无法从mRNA水平来判断。蛋白质本身的存在形式和活动规律，必须从直接对蛋白质的研究来解决。 内容：蛋白质分离 蛋白质分析 蛋白质相互作用 蛋白质组学在精神科学领域的应用 * * 2、生物信息学 人类基因组计划的直接结果是获得了海量的不连续的数据。蛋白质的复杂结构，繁杂的种类和活跃多样的相互作用，更是给生物信息学以很大的挑战。生物信息学是利用计算机对生命科学研究中的生物信息进行存储、检索和分析的科学。其研究主要是利用计算机存储核酸和蛋白质序列，研究科学算法，编制相应的软件对序列进行分析、比较与预测，从中发现规律。 * * 生物信息学数据库 目前，已经有美国的GenBank，欧洲的EMBL和日本的DDBJ等国际性DNA数据库，用户可以通过光盘或其他存储媒体以及通过Internet获得这些序列，包括最新的序列。蛋白质的一级结构也建立了相应的数据库，其中著名的有PIR和SWISS-PORT等；迄今为止，已经有约6000种蛋白质的空间结构被阐明，记录这些详尽空间结构的数据库为美国的PDB。 * * 生物信息学的目标和任务 生物信息学的研究目标是认识生命的起源、进化、遗传和发育的本质，破译隐藏在DNA序列中的遗传语言，揭示基因组信息结构的复杂性及遗传语言的根本规律，揭示人体生理的病理过程的分子基础，为人类疾病的诊断、预防和治疗提供最合理而有效的方法和途径。 目前生物信息主要的任务是： * * （1）获取人和各种生物的完整基因组 （2）发现新基因和新的单核苷酸多态性 （3）获取蛋白质组信息 （4）蛋白质结构及新药设计 （5）生物信息分析的技术与方法研究 　　　　　　　　完 * * 本 章 小 结 真核生物基因是以单顺反子的形式存在，编码的是单基因产物；而原核生物基因却是以多顺反子的形式存在，由它转录产生的是一种大分子量的mRNA，可同时编码两种甚至数种基因产物。原核生物的基因和真核生物的基因都可以分为编码区和非编码区。 * * 绝大多数真核生物其编码区被非编码区所打断，称为断裂基因；但是绝大多数的原核生物，其编码区则是连续的。当然，某些真核生物的基因也可能是连续，而某些原核生物中也有断裂基因存在。基因的大小与外显子没有关系，而是决定于内含子的大小和数目。内含子越多，片段越长，则其基因越大。真核生物中，从酵母到人类