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根基微生态环境 根际微生物研究进展 　　1904年，德国微生物学家 Lorenz Hiltner 提出了根际概念，他将根际定义为根系周围、受根系生长影响的土体。100多年来，根际研究方兴未艾，根际概念也不断得以丰富和完善。为纪念根际概念诞生100周年，亦为交流根际研究的最新进展，2004年9月在 Hiltner 的故乡、也是他曾工作多年的城市—慕尼黑召开了第一届国际根际大会。450多位国际根际研究专家参加了会议，会议分成16个分会，共有113个会议报告和308个墙报展示。微生物是整个会议交流的重点，共有9个分会、69篇会议报告和192篇墙报报告微生物的研究进展，分别占总数的56％、61％和62％。现根据会议交流情况结合近年来国际上根际微生物的研究动向，对根际微生物研究的最新进展和面临的挑战作一概要综述。 根际微生物研究方法进展 ( 1) 　环境微生物的生物多样性过去通常是用分离和培养技术加以研究的。近20年来，分子生态技术迅速发展，通过对环境16S rRNA 基因进行的大量研究表明，微生物生物多样性远比用传统方法估计的要高。微生物工作者惊奇发现环境中绝大部分微生物实际上从没有得到过培养，这些未培养的微生物与已培养的种群在系统发育上存在很大差距。根际与其他生境一样，用分子生态方法证明根际微生物不仅具有丰富的多样性，而且含有大量未培养的微生物种群。但是尽管在包括根际在内的不同生境中发现了大量未培养微生物，对这些微生物在环境中的功能目前仍了解很少。大部分根际过程的微生物学机理尚不清楚。深入理解根际微生物生化过程和植物—微生物相互作用的机理仍然是根际微生物工作所面临的重大挑战。近年来分子生态方法已取得了一系列新的突破性进展，这些新方法使探索根际微生物不同个体的生态功能成为可能。 根际微生物研究方法进展(2) 　在探索根际微生物功能的研究中，另一个新的方法是将稳定同位素标记技术与分子生态技术相结合。这是一个很有应用前景的方法，在研究植物—土壤生态系统物质流对根际微生物群落结构和功能的影响方面大有用途。根际碳流是土壤微生物生物多样性的主要驱动力。如何将根际碳流与微生物生物多样性联系起来一直是根际研究的一个重要命题。Radajewski 等首次报道稳定性同位素探针在环境微生物生态中的应用，此技术为测定微生物底物利用和功能研究提供了强有力手段，特别适合于根际生物过程的研究。技术要点是首先向受试环境供应 13C 标记底物，然后从环境提取核酸，用超速离心将核酸分成重核酸( 13C 标记)和轻核酸(非 13C 标记)若干部分。用分子生态技术分析 13C 标记和非标记的核酸，用系统发育分析方法确定‘活跃’和‘非活跃’微生物的种类。此技术可避免实验室培养而直接原位探测微生物种类的功能。目前此技术已经应用于探测有机污染物的生物分解。Prosser 等认为此技术可用于原位探测参与根际碳流的‘活跃’微生物群落。Lu 等用此技术测定了水稻根系的产甲烷古生菌和产乙酸细菌群落。 微生物生物多样性和生态功能 植物—微生物相互作用 　　在陆地生态系统中，植物是第一生产者，土壤微生物是有机质的分解者。植物将光合产物以根系分泌物和植物残体形式释放到土壤，供给土壤微生物碳源和能源；而微生物则将有机养分转化成无机养分，以利于植物吸收利用。这种植物—微生物的相互作用维系或主宰了陆地生态系统的生态功能。根据碳同位素示踪研究，禾谷类作物一生中，约有30％～60％光合同化产物转移到地下部，其中40％～90％以有机和无机分泌物形式释放到根际。Lynch 和 Wipps 将所有从根释放的物质定义为根际淀积，其成分和数量受植物种类、年龄、土壤生物、化学和物理因子的影响。 根际微生物是受植物影响最大的土壤微生物群体。与根外土壤比，可溶性根系分泌物为微生物提供了丰富的有效性碳源。Piutti 等研究了玉米根际微生物群体的季节性变化，在营养生长阶段，根际微生物活性和细菌丰度明显高于根外土壤，但在植物生殖生长阶段，由于根系可溶性碳的释放下降，根际效应随之消失，可培养细菌的生物多样性也明显下降。Zolotilina 等观察到沙漠野生植物的根际细菌种类比根外土壤多1.5～3陪，根际微生物数量在不同植物间有明显差异。Costa 等用 PCR-DGGE 方法对 16S rRNA 和18S rRNA 基因进行多态分析，发现细菌的 DGGE 指纹在根际和根外土壤有很大差别，根际微生物群体在不同植物间亦有很大差异。Marschner 等用相似方法研究了根距、土壤 pH、植物类型和共生菌根菌对根际细菌群体结构的影响。发现在玉米根际，离根2 mm 土壤的细菌群体明显不同于2 mm 以外土壤；在