RNA二级结构预测方法综述.pdfVIP

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第 2 期 电  子   学   报 Vol . 36  No . 2  2008 年 2 月 ACTA ELECTRONICA SINICA Feb .  2008   RNA 二级结构预测方法综述 邹  权 ,郭茂祖 ,张涛涛 ( 哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院 ,黑龙江哈尔滨 150001)   摘  要 :  RNA 二级结构预测是计算分子生物学中的一个重要领域. 本文介绍了 RNA 二级结构的预测方法 ,包括 该问题的数学模型 、主要算法思想以及每种算法对应的软件. 在 tRNA 和 RNase P RNA 数据库中随机选取了几组样例 对 目前主要的7 种软件进行测试 , 同时对每种软件的优缺点进行了详细比较. 实验证明 ,当存在同源序列时 ,P

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