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NGS技术在微生物研究中的应用
——序列物种功能
microbe@
科技服务部微生物事业部
北京诺禾致源生物信息科技有限公司
Outline
1 技术研究背景
2 扩增子测序技术
3 宏基因组测序技术
4 单菌技术
1 技术研究背景
不同地域和气候下
微生物物种和功能
医学 差异 （土壤、根系、
菌群的组成、功能与疾 农业 根内生菌）
病（如糖尿病、肥胖症、
高血压）之间的关系
（肠道、胃、口腔）
环境微生物
工业 畜牧 不同营养状态或免
业 疫水平下微生物物种和
发酵过程中微生物 功能差异 （瘤胃、肠道）
生物
群落和功能发生的变化 能源
（酒糟、酸奶、培养菌群）
可再生生物资源里微生物组成
及功能 （活性污泥、深海）
3
Outline
1 技术研究背景
2 扩增子测序技术
3 宏基因组测序技术
4 单菌技术
4
2 扩增子测序技术
无需分离培养 只需提取样本的DNA
5
2 扩增子测序技术
扩增子测序是对特定长度的PCR产物或者捕获片段进行测序 ，对环境样本
进行16s、ITS、18s高变区扩增产物测序，可研究属水平上的物种组成。
细菌多样性：16s V4 / V4 ＋V5
真菌多样性：ITS ITS1 / ITS2
真核微生物多样性：18s V4 / V9
功能基因：反硝化细菌nirS、固氮菌nifH等
6
2 扩增子测序技术
功能基因
产品介绍：通过对某个功能基因扩增后的产物进行高通量测序，研究该环境
样本中具有这一功能（固氮、氨氧化、反
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