初稿分子标记技术.pptVIP

四种分子标记技术在寄生虫分类鉴定上的应用;汇报内容;RAPD（random amplified polymorphic DNA）;RAPD原理;RAPD原理;不同基因组DNA总是一定差异的，所以用RAPD就可以进行分子标记研究。 理论上讲，在一定的扩增条件下，扩增的条带数取决于基因组的复杂性。对特定的引物，复杂性越高的基因组所产生的扩增条带数也越多。;RAPD 技术与PCR 技术区别;RAPD优点;RAPD缺点;AFLP分子标记技术原理;;AFLP分子标记技术方法;4：为使得扩增效果更好，反应一般分两步进行，即预扩增和选择性扩增 5：最后将获得的扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳或聚丙烯酰胺凝胶电泳．再经EB染色或银染后，清晰呈现片段长度的多态性。;AFLP引物包括三部分： 5′端的与人工接头序列互补的核心序列(core sequence，CORE)， 限制性内切酶特定序列(enzyme-specific sequence，ENZ) 和3′端的带有选择性碱基的粘性末(selective extension，EXT)。;使用特定的双链接头与酶切DNA片段连接作为扩增反应的模板. 用含有选择性碱基的引物对模板DNA进行扩增，选择性碱基的种类、数目和顺序决定了扩增片段的特殊性. 只有那些限制性位点侧翼的核苷酸与引物的选择性碱基相匹配的限制性片段才可被扩增. 扩增产物经放射性同位素标记、聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，然后根据凝胶上DNA指纹的有无来检验多态性.;AFLP优点;为什么要检测突变;SSCP:单链构象多态性原理;;SSCP方法;SSCP使用条件;SSCP局限性;微卫星;重复序列很短，一般只有1 bp～6 bp、长度仅为几百个bp。 在原核生物与真核生物中分布比较均匀。 随着每个重复单位碱基长度的增加微卫星位点数减少 其3种类型： 单一:(AT) n　　 复合型: (GT)n(AT)m　　 间断型: 重复序列中有其它核苷酸夹杂其中，如(GT)nGG(GT)m。;微卫星DNA 两端的序列多是相对保守的，所以亲缘关系相近的物种间是保守的，而且在一些紧密相关的物种中其重复单位和重复次数具有一定的相似性。 通过核苷酸链的滑动错配或者其它未知的过程来改变它们的长度,导致微卫星突变率高。 微卫星通常是复等位（MHC）的，代表每个微卫星位点的等位基因数目高度可变。 ;;;群体遗传学研究与遗传图谱的构建;法医学研究和亲子鉴定;动植物遗传???种和濒危野生动物的保护;微卫星在日本血吸虫方面的研究;　微卫星DNA 位点的获得;;引物的特异性测定;;;微卫星作用;微卫星缺点;