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分子模拟及药物设计软件分子模拟及药物设计软件MOEMOE
使用教程使用教程
基于MOE 2008.10
Molecular Operating Environment
教程概览
第一讲:MOE基本介绍及操作
分子建模分子建模、图形渲染图形渲染
第二讲:分子力学
力场力场、能量优化能量优化、力场约束力场约束
第三讲:构象搜索和分子叠合
构象分析、小分子交互式叠合、柔性叠合
第四讲:序列编辑器与蛋白建模
序列编辑器、同源建模
第五讲: 蛋白-配体复合物
分子对接、蛋白-配体相互作用模式图、分子表面
第六讲第六讲:MOEMOE数据库及化学信息学数据库及化学信息学
MOE数据库、导入SD文件、分子描述符计算、绘图
第一讲:MOE基本介绍及操作
分子建模、图形渲染
MOE的主要窗口 DBV (数据库浏览)
化学信息学化学信息学
描述符计算
MOE 指纹图谱
可视化图形
QSARQSAR
小分子建模
数据库清洗
能量优化
组合库设计
分子表面
CLI (SVL命令窗口)
计算过程结果输出 SEQ (序列编辑器)
SVL命令执行 蛋白信息学
同源建模同源建模
序列分析
MOE窗口
应用:
• 构建小分子
• 分子力学
• 基于结构的药物设计基于结构的药物设计
• 对接
• 分子动力学
• 柔性叠合
• 药效团构建
• 构象搜索
MOE窗口的结构
命令取消按钮
主菜单命令
SVL命令行
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